RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 TMCC2O75069 709 aa21.98■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 CFL1P23528 166 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 SLC37A1P57057 533 aa21.98■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 TAS2R43P59537 309 aa21.98■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 CBX3Q13185 183 aa21.98■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa21.98■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 SDR9C7Q8NEX9 313 aa21.98■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 OR1F2PQ96R84 312 aa21.98■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 HOXD1Q9GZZ0 328 aa21.98■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 PCDH15Q96QU1 1955 aa21.98■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 MCIDASD6RGH6 385 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 H3BMH7 237 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 OR1D4P47884 311 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 ARL4DP49703 201 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 OR1D5P58170 312 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF85Q03923 595 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 SCN1BQ07699 218 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 AKAP14Q86UN6 197 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 LRRC17Q8N6Y2 441 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF321PQ8N8H1 164 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 GATSQ8NAP1 163 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 OR4K13Q8NH42 304 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 OIT3Q8WWZ8 545 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 CLIP3Q96DZ5 547 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 C4orf36Q96KX1 117 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 UBQLN4Q9NRR5 601 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 CEP192Q8TEP8 1941 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 LRRN3E7EW58 273 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 CD53P19397 219 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 ALAS2P22557 587 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 TPTEP56180 551 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 HSD11B2P80365 405 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 FNDC7Q5VTL7 733 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 FAAH2Q6GMR7 532 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 ARL9Q6T311 187 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 SPATC1Q76KD6 591 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 NRARPQ7Z6K4 114 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 SLITRK4Q8IW52 837 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 SLC19A3Q9BZV2 496 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 RNF32Q9H0A6 362 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 LRRN3Q9H3W5 708 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa21.97■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 DVL2O14641 736 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 DYRK3O43781 588 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 OR7A10O76100 309 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 IL33O95760 270 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 UBL4AP11441 157 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 HPGDP15428 266 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 PPICP45877 212 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 CAPZA2P47755 286 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 MTNR1BP49286 362 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 CARTPTQ16568 116 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 PYDC2Q56P42 97 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 MZT2AQ6P582 158 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM151BQ8IW70 566 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 TSLPQ969D9 159 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 MVB12AQ96EY5 273 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 SLC46A1Q96NT5 459 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF337Q9Y3M9 751 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 E9PI62 339 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 J3QLW9 94 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF19P17023 458 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 F8A1P23610 371 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 RPL4P36578 427 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 ADH7P40394 386 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 TRAM1Q15629 374 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 CD226Q15762 336 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 WBP2NLQ6ICG8 309 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 CARFQ8N187 725 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 OR8D2Q9GZM6 311 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa21.96■■□□□ 1.11
TRIM54-201ENST00000296098 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa21.95■■□□□ 1.1
TRIM54-201ENST00000296098 A8MUA0 341 aa21.95■■□□□ 1.1
TRIM54-201ENST00000296098 SCDO00767 359 aa21.95■■□□□ 1.1
TRIM54-201ENST00000296098 PLPP2O43688 288 aa21.95■■□□□ 1.1
TRIM54-201ENST00000296098 HPGDSO60760 199 aa21.95■■□□□ 1.1
TRIM54-201ENST00000296098 CSF3P09919 207 aa21.95■■□□□ 1.1
TRIM54-201ENST00000296098 RORAP35398 523 aa21.95■■□□□ 1.1
TRIM54-201ENST00000296098 STARD6P59095 220 aa21.95■■□□□ 1.1
TRIM54-201ENST00000296098 SKP2Q13309 424 aa21.95■■□□□ 1.1
TRIM54-201ENST00000296098 TAB1Q15750 504 aa21.95■■□□□ 1.1
TRIM54-201ENST00000296098 LCN1P1Q5VSP4 162 aa21.95■■□□□ 1.1
TRIM54-201ENST00000296098 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TRIM54-201ENST00000296098 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TRIM54-201ENST00000296098 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa21.95■■□□□ 1.1
TRIM54-201ENST00000296098 NUP210LQ5VU65 1888 aa21.95■■□□□ 1.1
TRIM54-201ENST00000296098 SPAG17Q6Q759 2223 aa21.94■■□□□ 1.1
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.94■■□□□ 1.1
TRIM54-201ENST00000296098 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms