RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 TTLL10Q6ZVT0 673 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 UTS2BQ765I0 119 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SUN3Q8TAQ9 357 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 ATF6BQ99941 703 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 PINK1Q9BXM7 581 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 LHX9Q9NQ69 397 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 COMMD3Q9UBI1 195 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 LIMS3P0CW19 117 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 LIMS4P0CW20 117 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 APEX1P27695 318 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPAN31Q12999 210 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC9A5Q14940 896 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2G6Q5TZ20 316 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM64Q6YI46 380 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 CSNK1A1LQ8N752 337 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52N1Q8NH53 320 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 RGMAQ96B86 450 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 C10orf90Q96M02 699 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SAP130Q9H0E3 1048 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 OR51I1Q9H343 314 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 IL17BQ9UHF5 180 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A087WV48 116 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0G2JPF8 293 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SYT5O00445 386 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 B4GALT2O60909 372 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXC5Q00444 222 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 PRTGQ2VWP7 1150 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 OTULINQ96BN8 352 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 CARD8Q9Y2G2 431 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFB5O43674 189 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 OR12D1P0DN82 309 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNA8P32881 189 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC1A3P43003 542 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 BDH1Q02338 343 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 IL18Q14116 193 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SYPL1Q16563 259 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
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CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 KCT2Q8NC54 265 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SFXN5Q8TD22 340 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 MOAP1Q96BY2 351 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 HYLS1Q96M11 299 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 CUTCQ9NTM9 273 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 PADI1Q9ULC6 663 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 FITM1A5D6W6 292 aa24.22■■□□□ 1.47
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CAPNS1-201ENST00000246533 TCTE1Q5JU00 501 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL36Q8N4N3 616 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 DEDD2Q8WXF8 326 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC9A6Q92581 669 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 MR1Q95460 341 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 TM9SF2Q99805 663 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 NDC1Q9BTX1 674 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SERHL2Q9H4I8 314 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 FOLH1BQ9HBA9 442 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC22A11Q9NSA0 550 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 STMN3Q9NZ72 180 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SSUH2Q9Y2M2 353 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 M0R3H8 397 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
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CAPNS1-201ENST00000246533 P2RX3P56373 397 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
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CAPNS1-201ENST00000246533 ESX1Q8N693 406 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 CT55Q8WUE5 264 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 XAGE5Q8WWM1 108 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 OSTF1Q92882 214 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
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CAPNS1-201ENST00000246533 TM4SF19Q96DZ7 209 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 DPH1Q9BZG8 443 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 HPGDSO60760 199 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 TCN2P20062 427 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 OR1D4P47884 311 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAM2Q15035 370 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 HACD4Q5VWC8 232 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS41Q7RTY9 318 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF18BQ86Y91 864 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 MFSD9Q8NBP5 474 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 F2RL3Q96RI0 385 aa24.21■■□□□ 1.47
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