RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216294.4

SNAPC1-201, Transcript of small nuclear RNA activating complex polypeptide 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAPC1, Length 2,656 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1-201ENST00000216294 FAM131CQ96AQ9 280 aa14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 SIPA1Q96FS4 1042 aa14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 NDC1Q9BTX1 674 aa14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 APOOQ9BUR5 198 aa14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 OR51J1Q9H342 316 aa14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 FANCMQ8IYD8 2048 aa14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 GMDSO60547 372 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 CFDP00746 253 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 NPR2P20594 1047 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 TFF2Q03403 129 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 RIN1Q13671 783 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 HYAL4Q2M3T9 481 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 DCST2Q5T1A1 773 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 CEP76Q8TAP6 659 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 GIMAP1Q8WWP7 306 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 MS4A4EQ96PG1 132 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 TRAPPC13A5PLN9 417 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 GPR89AB7ZAQ6 455 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 TEX46H3BTG2 121 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 FGF17O60258 216 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 LYPD3O95274 346 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 MT-ND5P03915 603 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 GPR89BP0CG08 455 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 NT5EP21589 574 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 STOMP27105 288 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 SELENOPP49908 381 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 PER3P56645 1201 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 CREB3L2Q70SY1 520 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 ZNF527Q8NB42 609 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 MFSD9Q8NBP5 474 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 TTLQ8NG68 377 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 OR4K14Q8NGD5 310 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 OR52E2Q8NGJ4 325 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 HYLS1Q96M11 299 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 KCMF1Q9P0J7 381 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 SIGLEC7Q9Y286 467 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 A8MUA0 341 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 MPC2O95563 127 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 RAB3BP20337 219 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 GABRA3P34903 492 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 EMDP50402 254 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 ZNF81P51508 661 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 ZBTB37Q5TC79 503 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 COX18Q8N8Q8 333 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 TIMM29Q9BSF4 260 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 FLRT3Q9NZU0 649 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 ACOD1A6NK06 481 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 HCRTR1O43613 425 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 SSNA1O43805 119 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 CMPK1P30085 196 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 FAM53BQ14153 422 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 TEX261Q6UWH6 196 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 SCMH1Q96GD3 660 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 ZNF576Q9H609 170 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 OR6C2Q9NZP2 312 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 U3KQ87 197 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 A0A1B0GVT2 93 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 HRKO00198 91 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 DHFRP00374 187 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 HK1P19367 917 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 TNFRSF17Q02223 184 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 ZNF425Q6IV72 752 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 GID4Q8IVV7 300 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 LNX2Q8N448 690 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 LGALS14Q8TCE9 139 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 MRGPRX1Q96LB2 322 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 COQ7Q99807 217 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 MED17Q9NVC6 651 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 CALML5Q9NZT1 146 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1-201ENST00000216294 PLPP2O43688 288 aa14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1-201ENST00000216294 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1-201ENST00000216294 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1-201ENST00000216294 ZP1P60852 638 aa14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1-201ENST00000216294 PPP1CAP62136 330 aa14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1-201ENST00000216294 RPS15P62841 145 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1-201ENST00000216294 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1-201ENST00000216294 Q6ZTK2 550 aa14.58□□□□□ -0.08
SNAPC1-201ENST00000216294 ASPGQ86U10 573 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms