RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ELOA3BQ3SY89 546 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC22A10Q63ZE4 541 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 CDK20Q8IZL9 346 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 CLEC1AQ8NC01 280 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 ELOA3Q8NG57 546 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 FBLIM1Q8WUP2 373 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM43Q9BTV4 400 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 DPH1Q9BZG8 443 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC19A3Q9BZV2 496 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 DSN1Q9H410 356 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR70Q9NW82 654 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 TAS2R10Q9NYW0 307 aa22.65■■□□□ 1.22
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CAPNS1-215ENST00000628018 PCNX3Q9H6A9 2034 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa22.64■■□□□ 1.21
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CAPNS1-215ENST00000628018 NUP107P57740 925 aa22.64■■□□□ 1.21
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CAPNS1-215ENST00000628018 PRAMEF20Q5VT98 475 aa22.64■■□□□ 1.21
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CAPNS1-215ENST00000628018 RTL4Q6ZR62 310 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 P3H2Q8IVL5 708 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 BEST3Q8N1M1 668 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 THAP4Q8WY91 577 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 ING2Q9H160 280 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 PROK2Q9HC23 129 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 TEKT2Q9UIF3 430 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 OSGIN1Q9UJX0 560 aa22.64■■□□□ 1.21
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CAPNS1-215ENST00000628018 IL5RAQ01344 420 aa22.63■■□□□ 1.21
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CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM236Q5W0B7 351 aa22.63■■□□□ 1.21
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CAPNS1-215ENST00000628018 EGLN3Q9H6Z9 239 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 IL20Q9NYY1 176 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 STMN3Q9NZ72 180 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD33BA6NCL7 494 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 NKX2-8O15522 239 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 IGF2P01344 180 aa22.62■■□□□ 1.21
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CAPNS1-215ENST00000628018 GRINAQ7Z429 371 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF786Q8N393 782 aa22.62■■□□□ 1.21
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CAPNS1-215ENST00000628018 WDSUB1Q8N9V3 476 aa22.62■■□□□ 1.21
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CAPNS1-215ENST00000628018 ENO4A6NNW6 628 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 ELK4P28324 431 aa22.62■■□□□ 1.21
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF227Q86WZ6 799 aa22.62■■□□□ 1.21
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CAPNS1-215ENST00000628018 FADS6Q8N9I5 356 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM81AQ8TBF8 368 aa22.62■■□□□ 1.21
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CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD10Q9NXR5 420 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 MYRFQ9Y2G1 1151 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
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CAPNS1-215ENST00000628018 CYB561P49447 251 aa22.61■■□□□ 1.21
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CAPNS1-215ENST00000628018 CDK5R2Q13319 367 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 ABHD17BQ5VST6 288 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 C12orf73Q69YU5 71 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 LAIR2Q6ISS4 152 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 DEPDC4Q8N2C3 294 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 OR8D4Q8NGM9 314 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A19Q9HC21 320 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF6Q9Y252 685 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 CDH10Q9Y6N8 788 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 FREM2Q5SZK8 3169 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 ARGFXA6NJG6 315 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC42P60953 191 aa22.6■■□□□ 1.21
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