RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 RNF44Q7L0R7 432 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 CREB3L1Q96BA8 519 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 NDC1Q9BTX1 674 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 INPP5EQ9NRR6 644 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 MED31Q9Y3C7 131 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 F5P12259 2224 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 SPEGQ15772 3267 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 A0A0A6YYJ9 748 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 HOXB2P14652 356 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 S1PR1P21453 382 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 GPLD1P80108 840 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 CEP78Q5JTW2 689 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 CAMKVQ8NCB2 501 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 OR52R1Q8NGF1 315 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 ADAM30Q9UKF2 790 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 TTC36A6NLP5 189 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 CHP2O43745 196 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 SOX30O94993 753 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 NKX2-2O95096 273 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 HK1P19367 917 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 F8A1P23610 371 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF613Q6PF04 617 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 C7orf61Q8IZ16 206 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 FRMD1Q8N878 549 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 PBX4Q9BYU1 374 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 HDHD2Q9H0R4 259 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 CAPN10Q9HC96 672 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PRG6 482 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 FAM86C2PA6NEL3 165 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 ERP29P30040 261 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 TP53I3Q53FA7 332 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00114Q6XXX2 140 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 ZPLD1Q8TCW7 415 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 GHSRQ92847 366 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 RFT1Q96AA3 541 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 NIPAL2Q9H841 368 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 HAO2Q9NYQ3 351 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 CHRNA9Q9UGM1 479 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 ICAM5Q9UMF0 924 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PPK0 400 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 LRRN3E7EW58 273 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 ORC5O43913 435 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 ATF1P18846 271 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 CD53P19397 219 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 AHCYP23526 432 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 PITPNBP48739 271 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 NDUFAF6Q330K2 333 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 ACSM3Q53FZ2 586 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 CADM2Q8N3J6 435 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 SDR9C7Q8NEX9 313 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 ASB12Q8WXK4 309 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 RSC1A1Q92681 617 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 ORAI3Q9BRQ5 295 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 RBCK1Q9BYM8 510 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 NDEL1Q9GZM8 345 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 LRRN3Q9H3W5 708 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 TRPV5Q9NQA5 729 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 HEATR5AQ86XA9 2040 aa12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 PYCR1P32322 319 aa12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 SLC44A3Q8N4M1 653 aa12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC17Q8N6Y2 441 aa12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 OR51L1Q8NGJ5 315 aa12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF559Q9BR84 538 aa12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM5Q9Y2B1 443 aa12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 RIIAD1A6NNX1 92 aa12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 RDH16O75452 317 aa12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 ALX3O95076 343 aa12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 SRP54P61011 504 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 BTBD16Q32M84 506 aa12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 BCL2L15Q5TBC7 163 aa12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 OR51Q1Q8NH59 317 aa12.29□□□□□ -0.44
C9orf170-201ENST00000623052 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms