RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 YAE1D1Q9NRH1 226 aa22■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 ACER3Q9NUN7 267 aa22■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa22■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 TLDC2A0PJX2 215 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 SULT2B1O00204 365 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 CSTAP01040 98 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 G6PDP11413 515 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 MERTKQ12866 999 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 PDK3Q15120 406 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 SYT14P1Q58G82 188 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 AGAP6Q5VW22 663 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 OR2W6PQ8NHA6 318 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF350Q9GZX5 532 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 MKLN1Q9UL63 735 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 SSX4O60224 188 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 PGCP20142 388 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 PTNP21246 168 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 CLDN8P56748 225 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 NRF1Q16656 503 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 PGS1Q32NB8 556 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 FBXW9Q5XUX1 488 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 OLIG3Q7RTU3 272 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 CLECL1Q8IZS7 167 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 CLEC4FQ8N1N0 589 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 TUBGCP3Q96CW5 907 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 EMC3Q9P0I2 261 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 SPAG7O75391 227 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 MAPK14Q16539 360 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 PODNL1Q6PEZ8 512 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 TCP10LQ8TDR4 215 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 RHNO1Q9BSD3 238 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC106Q9BWC9 280 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF716A6NP11 495 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 IFNA2P01563 188 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV3-9P01782 118 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 PGM1P36871 562 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 EMX2Q04743 252 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 C11orf71Q6IPW1 123 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM108Q6UXF1 575 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 C16orf62Q7Z3J2 963 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 UBE2J2Q8N2K1 259 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 FAM71CQ8NEG0 241 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 MIPOL1Q8TD10 442 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 SLC35G5Q96KT7 338 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 EXD2Q9NVH0 621 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 MGAT4BQ9UQ53 548 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 E7EQL1 145 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 RAD51DO75771 328 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 GUSBP08236 651 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 TFPIP10646 304 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 TTKP33981 857 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 NTF4P34130 210 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 AP1ARQ63HQ0 302 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 OR4F3Q6IEY1 312 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 OR10H5Q8NGA6 315 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 OIT3Q8WWZ8 545 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.12e-9■■■■■ 84.3
PTPRF-216ENST00000617451 APH1AQ96BI3 265 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 CACNG6Q9BXT2 260 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 OR51I1Q9H343 314 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 ASIC5Q9NY37 505 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 SLC25A15Q9Y619 301 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 A0A096LNT2 108 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 CIB4A0PJX0 185 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 RNF212BA8MTL3 300 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 A8MV72 311 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA0513O60268 411 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 GPRIN2O60269 458 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 PTAFRP25105 342 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 OR52N5Q8NH56 324 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 ARL5BQ96KC2 179 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 DHRS9Q9BPW9 319 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 CTPS2Q9NRF8 586 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 CBLN4Q9NTU7 201 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 CHRNA9Q9UGM1 479 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 LGALS13Q9UHV8 139 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms