RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592790.1

VMP1-216, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

Gene VMP1, Length 4,325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-216	ENST00000592790	KXD1	Q9BQD3	176 aa		3.3	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		3.3	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	CHST8	Q9H2A9	424 aa		3.3	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	UBQLN3	Q9H347	655 aa		3.3	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	PIGM	Q9H3S5	423 aa		3.3	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		3.3	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	CMC2	Q9NRP2	79 aa		3.3	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		3.3	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		3.3	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		3.3	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	WDR90	Q96KV7	1748 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790		A0A087WUU8	490 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	C7orf66	A4D0T2	115 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	PLPP1	O14494	284 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	SDC3	O75056	442 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	HBQ1	P09105	142 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	CD3G	P09693	182 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	ADRB3	P13945	408 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	CPN1	P15169	458 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	TRIM23	P36406	574 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	LIMS1	P48059	325 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	SLC6A11	P48066	632 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	SGSH	P51688	502 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	TAF13	Q15543	124 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	MPPED2	Q15777	294 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF79	Q15937	498 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	UQCC3	Q6UW78	93 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	SHF	Q7M4L6	423 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	GPR135	Q8IZ08	494 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	GRHL3	Q8TE85	626 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	EDA	Q92838	391 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	KLHL15	Q96M94	604 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	GPR137	Q96N19	417 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	ARHGDIG	Q99819	225 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	CST11	Q9H112	138 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	GAREM1	Q9H706	876 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	RCE1	Q9Y256	329 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	PATJ	Q8NI35	1801 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790		A0A1B0GVC2	190 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	C5orf51	A6NDU8	294 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM212	A6NML5	194 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	HMSD	A8MTL9	139 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	SCD	O00767	359 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	GPR171	O14626	319 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	AXIN1	O15169	862 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	ARPC5	O15511	151 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF749	O43361	778 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	PLPP2	O43688	288 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	CHP2	O43745	196 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	TOX	O94900	526 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	NUDT14	O95848	222 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	IFNA21	P01568	189 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	IGHA1	P01876	353 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	MT-ND4	P03905	459 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	S1PR1	P21453	382 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	DRD5	P21918	477 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	ADH6	P28332	368 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	CD34	P28906	385 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	LIM2	P55344	173 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	BLOC1S1	P78537	153 aa		3.29	□□□□□ -1.88

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