RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588702.5

PRKAR1A-215, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene PRKAR1A, Length 622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-215ENST00000588702 CHRNA9Q9UGM1 479 aa17.09■□□□□ 0.33
PRKAR1A-215ENST00000588702 ZNF835Q9Y2P0 537 aa17.09■□□□□ 0.33
PRKAR1A-215ENST00000588702 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
PRKAR1A-215ENST00000588702 SHANK1Q9Y566 2161 aa17.09■□□□□ 0.33
PRKAR1A-215ENST00000588702 FIGNL2A6NMB9 653 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 TMEM229AB2RXF0 380 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 H3BML4 177 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 ACOT8O14734 319 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 FRS3O43559 492 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 SLC19A2O60779 497 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 WDR1O75083 606 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 CIB2O75838 187 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 PRKD3O94806 890 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 THRBP10828 461 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 ZNF708P17019 499 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 LHX2P50458 406 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 FOXK1P85037 733 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 FLOT2Q14254 428 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 ZSCAN26Q16670 478 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 GXYLT1Q4G148 440 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 ENTPD8Q5MY95 495 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 CYP2R1Q6VVX0 501 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 POC1BQ8TC44 478 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 DDIT4LQ96D03 193 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 PRDM14Q9GZV8 571 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 TIGARQ9NQ88 270 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 SPRR3Q9UBC9 169 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 SLC7A8Q9UHI5 535 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 OSGIN1Q9UJX0 560 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 POMPQ9Y244 141 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 ZGRF1Q86YA3 2104 aa17.08■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 TRAPPC13A5PLN9 417 aa17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 TPOP07202 933 aa17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 OR1E2P47887 323 aa17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 HOXC5Q00444 222 aa17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 HSF1Q00613 529 aa17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 ALG10BQ5I7T1 473 aa17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 C5orf46Q6UWT4 87 aa17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 VTCN1Q7Z7D3 282 aa17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 COMTD1Q86VU5 262 aa17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 ADGRG3Q86Y34 549 aa17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 OR5M1Q8NGP8 315 aa17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 ZPLD1Q8TCW7 415 aa17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 SLC38A4Q969I6 547 aa17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 MPP4Q96JB8 637 aa17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 MAGIXQ9H6Y5 334 aa17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 CTPS2Q9NRF8 586 aa17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 CAMK2AQ9UQM7 478 aa17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 TMED7Q9Y3B3 224 aa17.07■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 A0A0B4J2E0 115 aa17.06■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 A0A1B0GWA3 101 aa17.06■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 A0A1B0GX12 115 aa17.06■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 WISP2O76076 250 aa17.06■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 TAS2R41P59536 307 aa17.06■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 CHRNB3Q05901 458 aa17.06■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 ST3GAL3Q11203 375 aa17.06■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 ELOA3BQ3SY89 546 aa17.06■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 DEF8Q6ZN54 512 aa17.06■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 C10orf67Q8IYJ2 551 aa17.06■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 ELOA3Q8NG57 546 aa17.06■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa17.06■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa17.06■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 C3orf49Q96BT1 292 aa17.06■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 WDYHV1Q96HA8 205 aa17.06■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 KLHDC3Q9BQ90 382 aa17.06■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 CFAP46Q8IYW2 2715 aa17.06■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 A8MVM7 634 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 SHISA8B8ZZ34 492 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 ADAMDEC1O15204 470 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 CHP2O43745 196 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 TPST2O60704 377 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 OR5F1O95221 314 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 RHCEP18577 417 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 HTR2AP28223 471 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 SLC7A1P30825 629 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 STARP49675 285 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 CLDN18P56856 261 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 C1orf146Q5VVC0 180 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 LACC1Q8IV20 430 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 OR4D11Q8NGI4 311 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 RNF217Q8TC41 542 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 PRRC1Q96M27 445 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 KLHL15Q96M94 604 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 ZNF347Q96SE7 839 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 WFDC6Q9BQY6 131 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 POTEKPQ9BYX7 375 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 IL1RAPQ9NPH3 570 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 ALKBH4Q9NXW9 302 aa17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms