RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556321.1

PSMA3-210, Transcript of proteasome subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene PSMA3, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA3-210	ENST00000556321	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	DMTN	Q08495	405 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	PPP1R7	Q15435	360 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	RAB18	Q9NP72	206 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	HELT	A6NFD8	242 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	OR7A17	O14581	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	CASK	O14936	926 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	SERPINA3	P01011	423 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	FCGR3A	P08637	254 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	CALML3	P27482	149 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	MAGEA5	P43359	124 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	BRCC3	P46736	316 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	OR52J3	Q8NH60	311 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	RAD50	Q92878	1312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	WBP1	Q96G27	269 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	LGMN	Q99538	433 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	PLIN2	Q99541	437 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	PKIB	Q9C010	78 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	STRADB	Q9C0K7	418 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	EPOP	A6NHQ4	379 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	KCNAB3	O43448	404 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	TPST2	O60704	377 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	ERLIN1	O75477	346 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	JCHAIN	P01591	159 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	PCMT1	P22061	227 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC1A4	P43007	532 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	POU3F4	P49335	361 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC7A2	P52569	658 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	CCL23	P55773	120 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM50B	P56557	158 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	SRPX	P78539	464 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	NTHL1	P78549	312 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF33B	Q06732	778 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	RAB35	Q15286	201 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	CYS1	Q717R9	158 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM123	Q8N131	208 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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