RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	PIGM	Q9H3S5	423 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	GALNT8	Q9NY28	637 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM247	A6NEH6	219 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CFAP73	A6NFT4	308 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	GJE1	A6NN92	205 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985		A8MXE2	369 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	THBS1	P07996	1170 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CCNA2	P20248	432 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ENPP1	P22413	925 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC7A1	P30825	629 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	SSTR2	P30874	369 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CPA2	P48052	419 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	MTPN	P58546	118 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	HOXC5	Q00444	222 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	TLE4	Q04727	773 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	KLF10	Q13118	480 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	MYBPH	Q13203	477 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	NFYC	Q13952	458 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	GNA13	Q14344	377 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	RNF220	Q5VTB9	566 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	GRINA	Q7Z429	371 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	COMTD1	Q86VU5	262 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	PTOV1	Q86YD1	416 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	BBS10	Q8TAM1	723 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ABHD3	Q8WU67	409 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ARL5B	Q96KC2	179 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	OR5B2	Q96R09	309 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	PDZD2	O15018	2839 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM72	A0PK05	275 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	EVPLL	A8MZ36	301 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	C5orf58	C9J3I9	102 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	FAAH	O00519	579 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	MSTN	O14793	375 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	FRS3	O43559	492 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	TACR3	P29371	465 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CPOX	P36551	454 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	KIR2DL3	P43628	341 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CDK6	Q00534	326 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM27E3	Q08E93	113 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	SCARB2	Q14108	478 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	SYT14P1	Q58G82	188 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	REEP3	Q6NUK4	255 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	FCRLA	Q7L513	359 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	SERPINA11	Q86U17	422 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	SNX32	Q86XE0	403 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	LINC01560	Q8TB33	94 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	RNF128	Q8TEB7	428 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	LRRC46	Q96FV0	321 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF559	Q9BR84	538 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ARMCX1	Q9P291	453 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	FXYD1	O00168	92 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	TPST1	O60507	370 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	KRT34	O76011	436 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	TFPI	P10646	304 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CD8B	P10966	210 aa		10.03	□□□□□ -0.8

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