RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551920.1

GCN1-209, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, humanhuman

TSL 3

Gene GCN1, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1-209ENST00000551920 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 GRINAQ7Z429 371 aa14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ARPINQ7Z6K5 226 aa14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ZNF440Q8IYI8 595 aa14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 OR2V1Q8NHB1 315 aa14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 WNT2BQ93097 391 aa14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ZNF607Q96SK3 696 aa14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 SRXN1Q9BYN0 137 aa14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ABCD2Q9UBJ2 740 aa14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 SLC22A20A6NK97 555 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 M0QX08 132 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 CXCL13O43927 109 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 AQP8O94778 261 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 TACR3P29371 465 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 SLC1A3P43003 542 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 LIPEQ05469 1076 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 FOXF2Q12947 444 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ART3Q13508 389 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 DUSP7Q16829 419 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ZSWIM7Q19AV6 140 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 CCDC80Q76M96 950 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ZNF550Q7Z398 422 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ADGRG3Q86Y34 549 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 SLC30A8Q8IWU4 369 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 GCNT2Q8N0V5 402 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 OR2T12Q8NG77 320 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 CHRNA9Q9UGM1 479 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 TAGLN3Q9UI15 199 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 OSGIN1Q9UJX0 560 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ICE1Q9Y2F5 2266 aa14.68□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 A0A1W2PNR3 127 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 PRORSD1PA6NEY8 169 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 FAM90A27PA6NNH2 459 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 M0R3H8 397 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 TPST2O60704 377 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 SERPINB7O75635 380 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 KLK2P20151 261 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 GRNP28799 593 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 GSK3BP49841 420 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 PSME3P61289 254 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 VEZF1Q14119 521 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.069e-13■■■■□ 23.2
GCN1-209ENST00000551920 SYT14P1Q58G82 188 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 HBMQ6B0K9 141 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 MICU2Q8IYU8 434 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 CADM2Q8N3J6 435 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 OR4D11Q8NGI4 311 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 SLC35B4Q969S0 331 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 PRR14Q9BWN1 585 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 UCK2Q9BZX2 261 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ADAM19Q9H013 955 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ARMC7Q9H6L4 198 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ZNF175Q9Y473 711 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa14.67□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 TMEM72A0PK05 275 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 NKX2-6A6NCS4 301 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 HSPB2A8KAH6 182 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 C19orf84I3L1E1 186 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 NDUFAB1O14561 156 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 RCBTB2O95199 551 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 CLDN14O95500 239 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 UQCRBP14927 111 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 CCNA2P20248 432 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 KCNJ5P48544 419 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 TFF3Q07654 80 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 KRT72Q14CN4 511 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 GUSBP1Q15486 140 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 NPTX1Q15818 432 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 HSPB2Q16082 182 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 NRF1Q16656 503 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.66□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms