RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 PSD2Q9BQI7 771 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 RTN4RQ9BZR6 473 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 NDEL1Q9GZM8 345 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 UBQLN3Q9H347 655 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 KLHL1Q9NR64 748 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 SLC7A7Q9UM01 511 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 MED31Q9Y3C7 131 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 AP4B1Q9Y6B7 739 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 PCNX3Q9H6A9 2034 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 H0Y3Z8 333 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TPST2O60704 377 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 HCN1O60741 890 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TRAPPC6AO75865 159 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 CCNB2O95067 398 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 NTN1O95631 604 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 ATP6V1G2O95670 118 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 ACTL6AO96019 429 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 F10P00742 488 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 PRG2P13727 222 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 ZNF23P17027 643 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 ZNF24P17028 368 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TNFRSF1BP20333 461 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 GSTM3P21266 225 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 HTR2AP28223 471 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TACR3P29371 465 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 ERFP50548 548 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 GPR85P60893 370 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 PPIAP62937 165 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 PLAURQ03405 335 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 COX10Q12887 443 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TOMM20Q15388 145 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 BCL2A1Q16548 175 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 MICAQ29983 383 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 RFX4Q33E94 735 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 LINC00303Q3SY05 128 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 KRTCAP3Q53RY4 240 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 FGD3Q5JSP0 725 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 PDSS1Q5T2R2 415 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 OR5M10Q6IEU7 315 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 C3orf33Q6P1S2 294 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 ZNF730Q6ZMV8 503 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 COMTD1Q86VU5 262 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TEX19Q8NA77 164 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 OR4D11Q8NGI4 311 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 RNF217Q8TC41 542 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 GIPC3Q8TF64 312 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TMEM239Q8WW34 195 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 LRTOMTQ8WZ04 291 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 EME1Q96AY2 570 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 C3orf49Q96BT1 292 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 KCNK17Q96T54 332 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 ZNF426Q9BUY5 554 aa8.45□□□□□ -1.06
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CS-220ENST00000550700 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 ZNF556Q9HAH1 456 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 DEPPQ9NTK1 212 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 CHRNA9Q9UGM1 479 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 FBXL2Q9UKC9 423 aa8.45□□□□□ -1.06
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CS-220ENST00000550700 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TMED7Q9Y3B3 224 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TESMINQ9Y4I5 508 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 ORC6Q9Y5N6 252 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 SH3PXD2BA1X283 911 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 G3V3Y1 287 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 H0YJX3 145 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 FFAR1O14842 300 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TFECO14948 347 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 OIP5O43482 229 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 DNPH1O43598 174 aa8.44□□□□□ -1.06
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CS-220ENST00000550700 ADAP00813 363 aa8.44□□□□□ -1.06
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CS-220ENST00000550700 MT-ND1P03886 318 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 PEPDP12955 493 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 YAP1P46937 504 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 LIMS1P48059 325 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 RAC1P63000 192 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 HOXC5Q00444 222 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
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CS-220ENST00000550700 SNCBQ16143 134 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TMEM44Q2T9K0 475 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 NDUFAF6Q330K2 333 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 NHSL2Q5HYW2 709 aa8.44□□□□□ -1.06
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