RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 ZNF524Q96C55 264 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 PIGQQ9BRB3 760 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 NMUR2Q9GZQ4 415 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 SLC38A1Q9H2H9 487 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ZNF385DQ9H6B1 395 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CCDC134Q9H6E4 229 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 KCNJ16Q9NPI9 418 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 MED17Q9NVC6 651 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 VAPAQ9P0L0 249 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 Q9UFV3 132 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 NDUFAF1Q9Y375 327 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 MED12Q93074 2177 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CLDN24A6NM45 220 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CLCA1A8K7I4 914 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ZNF264O43296 627 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 KIAA0513O60268 411 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CTAG2O75638 210 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CSTAP01040 98 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 BCHEP06276 602 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 TFPTP0C1Z6 253 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 UBL4AP11441 157 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ZNF708P17019 499 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CHRNB4P30926 498 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CCR4P51679 360 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 SEC24CP53992 1094 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 GP2P55259 537 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CLDN15P56746 228 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CLDN20P56880 219 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 DSTNP60981 165 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 KCNJ10P78508 379 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 HPCAP84074 193 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 RGNQ15493 299 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 MAPK11Q15759 364 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 TMEM44Q2T9K0 475 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 PLPPR5Q32ZL2 321 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 LRIF1Q5T3J3 769 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CHMP1BQ7LBR1 199 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 MSRB3Q8IXL7 192 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 LILRB4Q8NHJ6 448 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 POC1BQ8TC44 478 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 GPR119Q8TDV5 335 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 SLC38A5Q8WUX1 472 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 RNF145Q96MT1 663 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 TMEM185BQ9H7F4 350 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CALHM2Q9HA72 323 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 HHATLQ9HCP6 504 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 POLE3Q9NRF9 147 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ICAM5Q9UMF0 924 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 LIPT1Q9Y234 373 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 L3MBTL1Q9Y468 752 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 TLN2Q9Y4G6 2542 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 A0A087WZY1 265 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 LOC100653049A0A140TA62 436 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CD8B2A6NJW9 211 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 B2RBV5 119 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ANGPT2O15123 496 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 EFNA2O43921 213 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 KRT34O76011 436 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 BPNT1O95861 308 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 GUSBP08236 651 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 LINGO3P0C6S8 592 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 IL7RP16871 459 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 IL11P20809 199 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 NOS3P29474 1203 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 RYKP34925 604 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 PGM1P36871 562 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 FGFBP1Q14512 234 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 BCL2A1Q16548 175 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 SGCBQ16585 318 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 AP1ARQ63HQ0 302 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 DLEU7Q6UYE1 221 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 LACC1Q8IV20 430 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ZZZ3Q8IYH5 903 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 C10orf111Q8N326 155 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 C9orf106Q8NAJ2 232 aa8.65□□□□□ -1.02
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