RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 ELFN2Q5R3F8 820 aa20.29■□□□□ 0.84
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PRDM4-202ENST00000547188 CASP12Q6UXS9 341 aa20.29■□□□□ 0.84
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PRDM4-202ENST00000547188 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
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PRDM4-202ENST00000547188 KATNB1Q9BVA0 655 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 SLC52A3Q9NQ40 469 aa20.29■□□□□ 0.84
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PRDM4-202ENST00000547188 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
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PRDM4-202ENST00000547188 CDH13P55290 713 aa20.26■□□□□ 0.83
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PRDM4-202ENST00000547188 SLC25A53Q5H9E4 307 aa20.25■□□□□ 0.83
PRDM4-202ENST00000547188 TECRLQ5HYJ1 363 aa20.25■□□□□ 0.83
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PRDM4-202ENST00000547188 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PRDM4-202ENST00000547188 OMGP23515 440 aa20.24■□□□□ 0.83
PRDM4-202ENST00000547188 MPGP29372 298 aa20.24■□□□□ 0.83
PRDM4-202ENST00000547188 CCR4P51679 360 aa20.24■□□□□ 0.83
PRDM4-202ENST00000547188 GNG11P61952 73 aa20.24■□□□□ 0.83
PRDM4-202ENST00000547188 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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PRDM4-202ENST00000547188 OR4F15Q8NGB8 312 aa20.24■□□□□ 0.83
PRDM4-202ENST00000547188 C16orf58Q96GQ5 468 aa20.24■□□□□ 0.83
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PRDM4-202ENST00000547188 NFU1Q9UMS0 254 aa20.24■□□□□ 0.83
PRDM4-202ENST00000547188 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa20.23■□□□□ 0.83
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PRDM4-202ENST00000547188 PPIHO43447 177 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
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