RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	IFT52	Q9Y366	437 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636		A0A0B4J293	547 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	GOLGA8R	I6L899	631 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ABCD4	O14678	606 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CTDSPL	O15194	276 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CD5L	O43866	347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PDE5A	O76074	875 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	KRT6A	P02538	564 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	NAGA	P17050	411 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	GM2A	P17900	193 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	DRD4	P21917	467 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	UGT1A1	P22309	533 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	GATA3	P23771	443 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	IL32	P24001	234 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	STX2	P32856	288 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PHB	P35232	272 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PTPN9	P43378	593 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MTNR1A	P48039	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	RASSF2	P50749	326 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	DAOA	P59103	153 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	HSF1	Q00613	529 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PCK2	Q16822	640 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	C4orf22	Q6V702	233 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CENPU	Q71F23	418 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	VRK2	Q86Y07	508 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	NSMAF	Q92636	917 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	RAB1C	Q92928	201 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	RIT1	Q92963	219 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	NXNL1	Q96CM4	212 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SPDL1	Q96EA4	605 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	LRR1	Q96L50	414 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FICD	Q9BVA6	458 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MMP27	Q9H306	513 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	AHSP	Q9NZD4	102 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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