RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ESM1	Q9NQ30	184 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	STK36	Q9NRP7	1315 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		3.38	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
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FAM49B-222	ENST00000522702	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF724	A8MTY0	619 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702		F5H6K3	240 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	KRT34	O76011	436 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	JCHAIN	P01591	159 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	MB	P02144	154 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SP1	P08047	785 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	HBQ1	P09105	142 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	AOC1	P19801	751 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PTN	P21246	168 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	GCA	P28676	217 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	NAMPT	P43490	491 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB9A	P51151	201 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PAX9	P55771	341 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CSNK2B	P67870	215 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	DHODH	Q02127	395 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	KLRC3	Q07444	240 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ITPK1	Q13572	414 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CUL1	Q13616	776 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
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FAM49B-222	ENST00000522702	HSDL2	Q6YN16	418 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SSX9	Q7RTT3	188 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	MICU2	Q8IYU8	434 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2L3	Q8NG85	312 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	GPX8	Q8TED1	209 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SERAC1	Q96JX3	654 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		3.37	□□□□□ -1.87
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FAM49B-222	ENST00000522702	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	BFAR	Q9NZS9	450 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	GALP	Q9UBC7	116 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	STARD10	Q9Y365	291 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	OARD1	Q9Y530	152 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	NWD1	Q149M9	1564 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	SHPRH	Q149N8	1683 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	AKAP12	Q02952	1782 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A0G2JLW4	131 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF879	B4DU55	563 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	C11orf98	E9PRG8	122 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM49B-222	ENST00000522702	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87

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