RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517028.1

RN7SKP99-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 99, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP99, Length 307 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP99-201ENST00000517028 OR5W2Q8NH69 310 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 BBS10Q8TAM1 723 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 ZFP90Q8TF47 636 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 PROX1Q92786 737 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 SLC25A36Q96CQ1 311 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 DDIT4LQ96D03 193 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 CMTM5Q96DZ9 223 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 TPD52L3Q96J77 140 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 FAM210AQ96ND0 272 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 TUBA1CQ9BQE3 449 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 ZNF559Q9BR84 538 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 SLC39A3Q9BRY0 314 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 TTYH2Q9BSA4 534 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 TAPBPLQ9BX59 468 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 UCK2Q9BZX2 261 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 OR2B2Q9GZK3 357 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 CALHM2Q9HA72 323 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 TMEM27Q9HBJ8 222 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 GP6Q9HCN6 339 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 POLE3Q9NRF9 147 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 MED17Q9NVC6 651 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 ADA2Q9NZK5 511 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 ARMCX1Q9P291 453 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 CLEC4AQ9UMR7 237 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 PROCRQ9UNN8 238 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 IFT52Q9Y366 437 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 EMC9Q9Y3B6 208 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 ZNF337Q9Y3M9 751 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 AP4B1Q9Y6B7 739 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 LAMA5O15230 3695 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 A0A1W2PQD3 144 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 BBIP1A8MTZ0 92 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 SULT2B1O00204 365 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 HMGN4O00479 90 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 AP3D1O14617 1153 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 ZNF195O14628 629 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 ANKRD28O15084 1053 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 UGT2B17O75795 530 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 DCTN3O75935 186 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 WISP2O76076 250 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 OR6A2O95222 327 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 ZNF682O95780 498 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 LDLRP01130 860 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 IGHG3P01860 377 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 GKN3PP0CG01 181 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 NQO1P15559 274 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 CD247P20963 164 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 ENPP1P22413 925 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 CTSSP25774 331 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 HTR3AP46098 478 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 NUDT2P50583 147 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 MTPNP58546 118 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 PHC1P78364 1004 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 KLF10Q13118 480 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 FADDQ13158 208 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 C1DQ13901 141 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 PON3Q15166 354 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 RGNQ15493 299 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 CD226Q15762 336 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 KCNMB1Q16558 191 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 ZSWIM7Q19AV6 140 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 REEP3Q6NUK4 255 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 PLXDC2Q6UX71 529 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 VRK2Q86Y07 508 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 KIF18BQ86Y91 864 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 ZNF440Q8IYI8 595 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 POU5F2Q8N7G0 328 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 C11orf65Q8NCR3 313 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 TNIP2Q8NFZ5 429 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 OR52E4Q8NGH9 312 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 OR2V1Q8NHB1 315 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 GTF2H4Q92759 462 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 OSTF1Q92882 214 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 MAL2Q969L2 176 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 FAM162AQ96A26 154 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP99-201ENST00000517028 RCN3Q96D15 328 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms