RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 DTNBP1Q96EV8 351 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 DOHHQ9BU89 302 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 EXO5Q9H790 373 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 CAB39LQ9H9S4 337 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 WDR41Q9HAD4 459 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 PROK2Q9HC23 129 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 ATRQ13535 2644 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 JMJD1CQ15652 2540 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 C17orf100A8MU93 164 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 RTCAO00442 366 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 OR10H2O60403 315 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 IFNA2P01563 188 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 RAF1P04049 648 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 CLPSP04118 112 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 PCNAP12004 261 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 NAGAP17050 411 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 KLK2P20151 261 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 GDF1P27539 372 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 OPRM1P35372 400 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 GCKP35557 465 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 BSGP35613 385 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 MTNR1AP48039 350 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 CDK9P50750 372 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 HERVK_113P63132 956 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 ERVK-8P63133 956 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 FUT7Q11130 342 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 SLAMF1Q13291 335 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 SNTA1Q13424 505 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 FAM83EQ2M2I3 478 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 C6orf163Q5TEZ5 329 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM198Q66K66 360 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 CPOQ8IVL8 374 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 SPATA6LQ8N4H0 392 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 L3MBTL4Q8NA19 623 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 NAXEQ8NCW5 288 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 OR7G1Q8NGA0 311 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 OR10G3Q8NGC4 313 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 RNFT2Q96EX2 444 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 RILPQ96NA2 401 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 ERP44Q9BS26 406 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 IFT27Q9BW83 186 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 ERVK-6Q9BXR3 956 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 ANGPTL4Q9BY76 406 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 OR51B5Q9H339 312 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 ALG9Q9H6U8 611 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 ACTR8Q9H981 624 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 CALHM2Q9HA72 323 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 CXorf21Q9HAI6 301 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 ERVK-19Q9WJR5 959 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 CFL2Q9Y281 166 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 ASB4Q9Y574 426 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 COL6A5A8TX70 2615 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 GAGE12JA6NER3 117 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 SUPT3HB4E1H0 165 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 ACOX3O15254 700 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 GUCY1B2O75343 617 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 SUPT3HO75486 399 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 AIFM1O95831 613 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 ACTL6AO96019 429 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 ATP1B1P05026 303 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 FGF2P09038 288 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 CPN1P15169 458 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 SSTR1P30872 391 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 DCAF7P61962 342 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 SLMAPQ14BN4 828 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 CEBPEQ15744 281 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 GGTA1PQ4G0N0 100 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 FBXO48Q5FWF7 155 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 C18orf63Q68DL7 685 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 KLC3Q6P597 504 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 CYP20A1Q6UW02 462 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 RAPH1Q70E73 1250 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 PAGE2Q7Z2X7 111 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-222ENST00000514552 BIVMQ86UB2 503 aa6.11□□□□□ -1.43
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