RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512153.5

COPB2-208, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 4

Gene COPB2, Length 629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-208ENST00000512153 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 MAGEA8P43361 318 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 SERPINB8P50452 374 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 ARFIP2P53365 341 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 NAB1Q13506 487 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 RIN1Q13671 783 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 QPRTQ15274 297 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 EFNB3Q15768 340 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 DUSP5Q16690 384 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 IMPG1Q17R60 797 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 TEX35Q5T0J7 233 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 GALNT18Q6P9A2 607 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 SPATA21Q7Z572 469 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 OR51F2Q8NH61 342 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 PIGXQ8TBF5 258 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 DNAJA3Q96EY1 480 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 SLC38A2Q96QD8 506 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 SLC6A7Q99884 636 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 HOXD1Q9GZZ0 328 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 TREM2Q9NZC2 230 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 ICAM5Q9UMF0 924 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 SNX12Q9UMY4 172 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 PPIAL4AQ9Y536 164 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 TRAV20A0A0B4J274 112 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 PDPK1O15530 556 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 OIP5O43482 229 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 SUPT7LO94864 414 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 H6PDO95479 791 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 PNPP00491 289 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 ADRA2AP08913 450 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 HKR1P10072 659 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 ANPEPP15144 967 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 NPR2P20594 1047 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 FPR2P25090 351 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 HSD17B3P37058 310 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 KHKP50053 298 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 UBA52P62987 128 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 SLC25A3Q00325 362 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 CLCQ05315 142 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 MERTKQ12866 999 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 CBFBQ13951 182 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 NDUFAF6Q330K2 333 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 ZNF311Q5JNZ3 666 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 FAM71E1Q6IPT2 247 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 SLC35F6Q8N357 371 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 OR4F15Q8NGB8 312 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 OR5W2Q8NH69 310 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 CLDND2Q8NHS1 167 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 ZFP28Q8NHY6 868 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 MS4A4EQ96PG1 132 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 KATNB1Q9BVA0 655 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 BTBD2Q9BX70 525 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 DPH5Q9H2P9 285 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 SLC52A3Q9NQ40 469 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 MED29Q9NX70 200 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 ARMCX1Q9P291 453 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 ZNF225Q9UK10 706 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 TFP02787 698 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 SAGP10523 405 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 MPGP29372 298 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 MAP3K8P41279 467 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 OR2B6P58173 313 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 HIKESHIQ53FT3 197 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 KLHL26Q53HC5 615 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 SYT14P1Q58G82 188 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 CDC73Q6P1J9 531 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 ANKRD16Q6P6B7 361 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 CCDC103Q8IW40 242 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 NANPQ8TBE9 248 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 TMEM234Q8WY98 164 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 C16orf58Q96GQ5 468 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 ARL5BQ96KC2 179 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 ANKRD27Q96NW4 1050 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 TPK1Q9H3S4 243 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 NTN4Q9HB63 628 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 OBP2BQ9NPH6 170 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 SLC7A10Q9NS82 523 aa9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 ZNF716A6NP11 495 aa9.22□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 ZNF264O43296 627 aa9.22□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 ALX3O95076 343 aa9.22□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 IFI6P09912 130 aa9.22□□□□□ -0.93
COPB2-208ENST00000512153 GAAP10253 952 aa9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms