RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 SYPL1Q16563 259 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 ISXQ2M1V0 245 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARHGAP40Q5TG30 622 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNLSQ5VYX0 342 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 C18orf63Q68DL7 685 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 PGBD2Q6P3X8 592 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 BHLHB9Q6PI77 547 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 DHRS13Q6UX07 377 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM64Q6YI46 380 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF793Q6ZN11 406 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 GLRX5Q86SX6 157 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 PIP4P1Q86T03 277 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLITRK4Q8IW52 837 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF595Q8IYB9 648 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 CADM3Q8N126 398 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC34A3Q8N130 599 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 CA13Q8N1Q1 262 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 PARP16Q8N5Y8 322 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 AMER3Q8N944 861 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 POC5Q8NA72 575 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR8J1Q8NGP2 316 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR51Q1Q8NH59 317 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 SFXN5Q8TD22 340 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 NR4A3Q92570 626 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 MOAP1Q96BY2 351 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 PEX11GQ96HA9 241 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 CEP19Q96LK0 163 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF285Q96NJ3 590 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 OPALINQ96PE5 141 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR5M11Q96RB7 305 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 TAAR9Q96RI9 348 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 IL4I1Q96RQ9 567 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPATA25Q9BR10 227 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 FUZQ9BT04 418 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 CENPOQ9BU64 300 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC32Q9BV29 185 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 FNDC11Q9BVV2 318 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 MND1Q9BWT6 205 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 TAPBPLQ9BX59 468 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 NUAK2Q9H093 628 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 SIAEQ9HAT2 523 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 SMURF1Q9HCE7 757 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 BCL2L10Q9HD36 194 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLAMF7Q9NQ25 335 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 LHX9Q9NQ69 397 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 POLE4Q9NR33 117 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 OCIAD1Q9NX40 245 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 TAS2R7Q9NYW3 318 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCMF1Q9P0J7 381 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRPC4Q9UBN4 977 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 SEC14L4Q9UDX3 406 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 ACAD8Q9UKU7 415 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATG4BQ9Y4P1 393 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAU2Q9Y6X3 613 aa5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 VPS13AQ96RL7 3174 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYO15AQ9UKN7 3530 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 PCNX2A6NKB5 2137 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPTBP11277 2137 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC187A0A096LP49 1063 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A0G2JPF8 293 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM227AF5H4B4 570 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 M0R3H8 397 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYL12BO14950 172 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 CASC3O15234 703 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 FOXS1O43638 330 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR10H2O60403 315 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 CSO75390 466 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 NME6O75414 186 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPX5O75715 221 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 SOX14O95416 240 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 AIFM1O95831 613 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 APOA1P02647 267 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 IFNA16P05015 189 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 HEXBP07686 556 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 FHP07954 510 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADRA2AP08913 450 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 C8orf89P0DMQ9 161 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR12D1P0DN82 309 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 FGF5P12034 268 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 IFNGR2P38484 337 aa5.14□□□□□ -1.59
ARHGEF3-215ENST00000498517 FEN1P39748 380 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms