RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 MANEAQ5SRI9 462 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 XKRXQ6PP77 449 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
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PRAME-213ENST00000492657 MED31Q9Y3C7 131 aa11.86□□□□□ -0.51
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PRAME-213ENST00000492657 NPSR1Q6W5P4 371 aa11.85□□□□□ -0.51
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PRAME-213ENST00000492657 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 MED30Q96HR3 178 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 LRRN3Q9H3W5 708 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 LRIT1Q9P2V4 623 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 A0A0B4J2E0 115 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GX12 115 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 PTP4A3O75365 173 aa11.85□□□□□ -0.51
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PRAME-213ENST00000492657 CRMP1Q14194 572 aa11.85□□□□□ -0.51
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PRAME-213ENST00000492657 PARGQ86W56 976 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
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PRAME-213ENST00000492657 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
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PRAME-213ENST00000492657 TTTY10Q9BZA0 68 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 ACOXLQ9NUZ1 547 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 HSPB11Q9Y547 144 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PPC4 97 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 HMX3A6NHT5 357 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
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PRAME-213ENST00000492657 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 RCBTB2O95199 551 aa11.84□□□□□ -0.51
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PRAME-213ENST00000492657 YES1P07947 543 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 PAICSP22234 425 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 HCCSP53701 268 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 TMEM44Q2T9K0 475 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 TIGD4Q8IY51 512 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 CDK20Q8IZL9 346 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 GHDCQ8N2G8 530 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 ARL14Q8N4G2 192 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 OR52N1Q8NH53 320 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 NEIL3Q8TAT5 605 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 ENKURQ8TC29 256 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 LMF1Q96S06 567 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 TEAD3Q99594 435 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 ZNF559Q9BR84 538 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 ZNF576Q9H609 170 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 CLDN16Q9Y5I7 305 aa11.84□□□□□ -0.51
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