RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 AP3S1Q92572 193 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 KLK6Q92876 244 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 KCNC2Q96PR1 638 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 OR2M2Q96R28 347 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 KATNB1Q9BVA0 655 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 EVA1AQ9H8M9 152 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 BPIFA1Q9NP55 256 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 IMPAD1Q9NX62 359 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MS4A12Q9NXJ0 267 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 OR6C2Q9NZP2 312 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 FTSJ1Q9UET6 329 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SSR3Q9UNL2 185 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 IL33O95760 270 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 FABP3P05413 133 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PRG2P13727 222 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 C4BPBP20851 252 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CALCRP30988 508 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SDC2P34741 201 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SLC6A12P48065 614 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PLAG1Q6DJT9 500 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 TMEM71Q6P5X7 295 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 C3P1Q6ZMU1 363 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MISP3Q96FF7 219 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 LRRN3Q9H3W5 708 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 DLL4Q9NR61 685 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 TREM2Q9NZC2 230 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ICKQ9UPZ9 632 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.11□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 OR51F1A6NGY5 319 aa7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CASC3O15234 703 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 G6PDP11413 515 aa7.1□□□□□ -1.27
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USP4-211ENST00000485450 SOX3P41225 446 aa7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 HSPA7P48741 367 aa7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ITGA1P56199 1179 aa7.1□□□□□ -1.27
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USP4-211ENST00000485450 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CLN3Q13286 438 aa7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 COTL1Q14019 142 aa7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 OPCMLQ14982 345 aa7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 P2RY14Q15391 338 aa7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SSX2Q16385 188 aa7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CNIH2Q6PI25 160 aa7.1□□□□□ -1.27
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USP4-211ENST00000485450 IFI44Q8TCB0 444 aa7.1□□□□□ -1.27
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USP4-211ENST00000485450 PIPP12273 146 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
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USP4-211ENST00000485450 OR4D1Q15615 310 aa7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 C3orf38Q5JPI3 329 aa7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 Q6ZSR9 355 aa7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SHFQ7M4L6 423 aa7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 VRK3Q8IV63 474 aa7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ZFP82Q8N141 532 aa7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 TMEM163Q8TC26 289 aa7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 NUDT8Q8WV74 236 aa7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 TM4SF19Q96DZ7 209 aa7.1□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 LRRC46Q96FV0 321 aa7.1□□□□□ -1.27
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USP4-211ENST00000485450 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
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