RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484048.1

UBE2E1-209, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2E1, Length 786 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1-209ENST00000484048 IFNA8P32881 189 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 UQCRFS1P47985 274 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 MASP1P48740 699 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 IST1P53990 364 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 SESN3P58005 492 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 SMIM11AP58511 58 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 GPR85P60893 370 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 COPZ1P61923 177 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 DGCR6Q14129 220 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 GK3PQ14409 553 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 QPRTQ15274 297 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 CADM2Q8N3J6 435 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 CATSPER1Q8NEC5 780 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 OR2M7Q8NG81 312 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 OR4K17Q8NGC6 315 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 OR4C15Q8NGM1 316 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 C5orf34Q96MH7 638 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 ANKRD19PQ9H560 264 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 TAS2R10Q9NYW0 307 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 FBXL2Q9UKC9 423 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 SLC7A7Q9UM01 511 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 CSAG2Q9Y5P2 127 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 U3KQV3 271 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E1-209ENST00000484048 MED12Q93074 2177 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 DNAJC13O75165 2243 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 PINLYPA6NC86 204 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 LRRC3CA6NJW4 275 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TNFRSF11BO00300 401 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 CHP2O43745 196 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 FPR1P21462 350 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 DLX5P56178 289 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 FOXO1Q12778 655 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TRAM2Q15035 370 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ZNF766Q5HY98 468 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ALG10BQ5I7T1 473 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ULK3Q6PHR2 472 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 EPHX4Q8IUS5 362 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 SULF2Q8IWU5 870 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ICA1LQ8NDH6 482 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 OR5K1Q8NHB7 308 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ZNF563Q8TA94 476 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ST8SIA1Q92185 356 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TM9SF4Q92544 642 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 C3orf49Q96BT1 292 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 PRSS27Q9BQR3 290 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 FUZQ9BT04 418 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ADAM19Q9H013 955 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 PTGES2Q9H7Z7 377 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 KLHL1Q9NR64 748 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 OAZ3Q9UMX2 235 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 CENPEQ02224 2701 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 CSMD1Q96PZ7 3565 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 PEX1O43933 1283 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 E2F6O75461 281 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 CBR3O75828 277 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ZNF23P17027 643 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 SLC1A3P43003 542 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TRIP10Q15642 601 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 PLPPR5Q32ZL2 321 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ARSKQ6UWY0 536 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 SVOPLQ8N434 492 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ZADH2Q8N4Q0 377 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TMEM178AQ8NBL3 297 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 OR52J3Q8NH60 311 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TMEM234Q8WY98 164 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 SLC38A4Q969I6 547 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 NRBF2Q96F24 287 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 GNRHR2Q96P88 292 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 C12orf10Q9HB07 376 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ZFP64Q9NPA5 681 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 MED17Q9NVC6 651 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 STOML1Q9UBI4 398 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ZNF407Q9C0G0 2248 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 SAC3D1A6NKF1 404 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 PDGFAP04085 211 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 RNF224P0DH78 156 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms