RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 ZSWIM7Q19AV6 140 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 ZNF311Q5JNZ3 666 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 REEP3Q6NUK4 255 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 C3orf33Q6P1S2 294 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 BTLAQ7Z6A9 289 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 LUZP2Q86TE4 346 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 ZNF440Q8IYI8 595 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 ROBO4Q8WZ75 1007 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 LRRC46Q96FV0 321 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 A8MXE2 369 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 CGAP01215 116 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 SIRPAP78324 504 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 SCARB2Q14108 478 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 COQ5Q5HYK3 327 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 FAM214BQ7L5A3 538 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 GDF7Q7Z4P5 450 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 PTOV1Q86YD1 416 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 C14orf79Q96F83 325 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 TIGARQ9NQ88 270 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 CHRNA9Q9UGM1 479 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 CELSR2Q9HCU4 2923 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 LOC100653049A0A140TA62 436 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 MSTNO14793 375 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 KRT34O76011 436 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 PRG2P13727 222 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 SLC6A2P23975 617 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 SLC7A1P30825 629 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 SLC1A3P43003 542 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 HTR3AP46098 478 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 SEC24CP53992 1094 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 RAC3P60763 192 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 MAPRE2Q15555 327 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 SYT14P1Q58G82 188 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 SNX32Q86XE0 403 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 OR5B2Q96R09 309 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 ADAM19Q9H013 955 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 ARMCX1Q9P291 453 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 OSGIN1Q9UJX0 560 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 PRDM4Q9UKN5 801 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 CLEC4AQ9UMR7 237 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 MAST4O15021 2626 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 ITPR2Q14571 2701 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 FXYD1O00168 92 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 SLC22A2O15244 555 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 ENPP1P22413 925 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 TACR3P29371 465 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 REP15Q6BDI9 236 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 NANOGP8Q6NSW7 305 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 TMPPEQ6ZT21 453 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 ZNF550Q7Z398 422 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 HIPK4Q8NE63 616 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 RNF128Q8TEB7 428 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 ARMC7Q9H6L4 198 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 NANOGQ9H9S0 305 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 GLRX2Q9NS18 164 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 KCNN3Q9UGI6 736 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 CAPN7Q9Y6W3 813 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 BBIP1A8MTZ0 92 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 DYNC1I1O14576 645 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP18.71■□□□□ 0.593e-14■■■■□ 21.3
ACTB-211ENST00000480301 CD8BP10966 210 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 UQCRBP14927 111 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 PRKAR1BP31321 381 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 PEX19P40855 299 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 CPA2P48052 419 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 GZMMP51124 257 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 GYS2P54840 703 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 RBBP4Q09028 425 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 MMEL1Q495T6 779 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 FCRLAQ7L513 359 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 SERPINA11Q86U17 422 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 COMTD1Q86VU5 262 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 ABHD3Q8WU67 409 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 LRRC58Q96CX6 371 aa18.71■□□□□ 0.59
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