RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476342.1

HOXB3-208, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,420 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-208ENST00000476342 TTYH2Q9BSA4 534 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-208ENST00000476342 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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HOXB3-208ENST00000476342 EFNA2O43921 213 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-208ENST00000476342 HSD17B1P14061 328 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-208ENST00000476342 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-208ENST00000476342 HTR1EP28566 365 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-208ENST00000476342 SFTPDP35247 375 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-208ENST00000476342 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.852e-6■■□□□ 13
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HOXB3-208ENST00000476342 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
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HOXB3-208ENST00000476342 CLEC18CQ8NCF0 446 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-208ENST00000476342 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa26.61■■□□□ 1.85
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HOXB3-208ENST00000476342 C1orf21Q9H246 121 aa26.61■■□□□ 1.85
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HOXB3-208ENST00000476342 CHRNA9Q9UGM1 479 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-208ENST00000476342 CLCA1A8K7I4 914 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-208ENST00000476342 H0YC42 278 aa26.6■■□□□ 1.85
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HOXB3-208ENST00000476342 OPN1LWP04000 364 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-208ENST00000476342 TACR3P29371 465 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF136P52737 540 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-208ENST00000476342 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
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HOXB3-208ENST00000476342 PACSIN3Q9UKS6 424 aa26.6■■□□□ 1.85
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HOXB3-208ENST00000476342 CYBRD1Q53TN4 286 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-208ENST00000476342 RINLQ6ZS11 566 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-208ENST00000476342 ARHGAP24Q8N264 748 aa26.59■■□□□ 1.85
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HOXB3-208ENST00000476342 FAM162AQ96A26 154 aa26.58■■□□□ 1.85
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HOXB3-208ENST00000476342 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-208ENST00000476342 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-208ENST00000476342 C3orf49Q96BT1 292 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-208ENST00000476342 TPD52L3Q96J77 140 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-208ENST00000476342 TIGARQ9NQ88 270 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-208ENST00000476342 TAS2R1Q9NYW7 299 aa26.56■■□□□ 1.84
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