RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 TUBB1Q9H4B7 451 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 MYO7BQ6PIF6 2116 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 EFCAB9A8MZ26 197 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TACR3P29371 465 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 MAGEA5P43359 124 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 LCN10Q6JVE6 187 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 OAFQ86UD1 273 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SULF2Q8IWU5 870 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 DPP10Q8N608 796 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 NEURL3Q96EH8 262 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 KLHL15Q96M94 604 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TBC1D23Q9NUY8 699 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 GRHPRQ9UBQ7 328 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CHD5Q8TDI0 1954 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 FRS3O43559 492 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CCL3P10147 92 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 GALNSP34059 522 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 STARP49675 285 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SELENBP1Q13228 472 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CES4AQ5XG92 561 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 ULK3Q6PHR2 472 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 USP43Q70EL4 1123 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SLC38A6Q8IZM9 456 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 MOSPD2Q8NHP6 518 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CYGBQ8WWM9 190 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 C8orf4Q9NR00 106 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 LANCL2Q9NS86 450 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SEMA5BQ9P283 1151 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 A0A1B0GTL3 188 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 PRSS44E7EML9 344 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 PLOD2O00469 737 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 GPX3P22352 226 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SRD5A2P31213 254 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 FGFBP1Q14512 234 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 PIGGQ5H8A4 983 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 GRINAQ7Z429 371 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 UBE3DQ7Z6J8 389 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 DTX1Q86Y01 620 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CMIPQ8IY22 773 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 FBXO27Q8NI29 283 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 APH1AQ96BI3 265 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SDF2Q99470 211 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CDH20Q9HBT6 801 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TMED7Q9Y3B3 224 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 RTTNQ86VV8 2226 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SUSD5O60279 629 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CCNB2O95067 398 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CH25HO95992 272 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 UMODP07911 640 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 OR1E2P47887 323 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 C9orf135Q5VTT2 229 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 GALNT5Q7Z7M9 940 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 OR51A7Q8NH64 312 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CCDC106Q9BWC9 280 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SEMA4CQ9C0C4 833 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 RIBC2Q9H4K1 309 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF226Q9NYT6 803 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM181Q9P2C4 612 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 ATPIF1Q9UII2 106 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CEPT1Q9Y6K0 416 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TRIM64A6NGJ6 449 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TRIM64BA6NI03 449 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CD79AP11912 226 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 ACVR2AP27037 513 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TNFSF10P50591 281 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 NPRL3Q12980 569 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 MAPK14Q16539 360 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 XKR7Q5GH72 579 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SIGIRRQ6IA17 410 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 C5orf46Q6UWT4 87 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 GCNT2Q8N0V5 402 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SLC43A2Q8N370 569 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 EVA1AQ9H8M9 152 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 ASIC5Q9NY37 505 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 KLK4Q9Y5K2 254 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 PTPN13Q12923 2485 aa8.47□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 HSPB2A8KAH6 182 aa8.47□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SLC19A2O60779 497 aa8.47□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 PRAMEF4O60810 478 aa8.47□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 PRKD3O94806 890 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms