RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 MACC1Q6ZN28 852 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 NAA40Q86UY6 237 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM71CQ8NEG0 241 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2A7Q96R45 310 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TAAR9Q96RI9 348 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 EGLN3Q9H6Z9 239 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CERS4Q9HA82 394 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 NOX3Q9HBY0 568 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 HRASLSQ9HDD0 168 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CTPS2Q9NRF8 586 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM248Q9NWD8 314 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ASB6Q9NWX5 421 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OPN4Q9UHM6 478 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PRB8 838 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PGRMC2O15173 223 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CHST10O43529 356 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF13O43567 381 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 NFATC1O95644 943 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CH25HO95992 272 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ANXA5P08758 320 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 QDPRP09417 244 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TYRP14679 529 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SOAT1P35610 550 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR143P51810 404 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 H2BFSP57053 126 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 BLOC1S1P78537 153 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 HTD2P86397 168 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RING1Q06587 406 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF385BQ569K4 471 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TCTN3Q6NUS6 607 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 H3F3CQ6NXT2 135 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 APOOLQ6UXV4 268 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR52N2Q8NGI0 321 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 UBTD2Q8WUN7 234 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OVCA2Q8WZ82 227 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RGMAQ96B86 450 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SCLYQ96I15 445 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFP42Q96MM3 310 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 WFDC6Q9BQY6 131 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RASL12Q9NYN1 266 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MARK1Q9P0L2 795 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 IRGMA1A4Y4 181 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ANHXE9PGG2 379 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJB6O75190 326 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GP1BAP07359 652 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CD63P08962 238 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GAAP10253 952 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 IDSP22304 550 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MMP11P24347 488 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MPGP29372 298 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1E1P30953 314 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CDH11P55287 796 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PITPNAQ00169 270 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ECH1Q13011 328 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 DYRK1AQ13627 763 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ERV3-1Q14264 604 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MS4A13Q5J8X5 152 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 LINGO2Q7L985 606 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SCD5Q86SK9 330 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SYT9Q86SS6 491 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CPXM2Q8N436 756 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 HORMAD2Q8N7B1 307 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF248Q8NDW4 579 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TMIEQ8NEW7 156 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SORCS1Q8WY21 1168 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 FGF11Q92914 225 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PNPLA2Q96AD5 504 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GPA33Q99795 319 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TM6SF2Q9BZW4 377 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 XKR8Q9H6D3 395 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNK12Q9HB15 430 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ANGPT4Q9Y264 503 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC22A14Q9Y267 594 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 DENND4CQ5VZ89 1909 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MGAT4DA6NG13 374 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms