RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 SERINC1Q9NRX5 453 aa8.77□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 SACM1LQ9NTJ5 587 aa8.77□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CLN6Q9NWW5 311 aa8.77□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 IMPAD1Q9NX62 359 aa8.77□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TAS2R10Q9NYW0 307 aa8.77□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 KLRF1Q9NZS2 232 aa8.77□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.77□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa8.77□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 PMS2P1A4D2B8 440 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TRIM64A6NGJ6 449 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 A8MVM7 634 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 EFCAB9A8MZ26 197 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF208O43345 1280 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 SLC25A12O75746 678 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CBR3O75828 277 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 NUDT14O95848 222 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 MT-ATP6P00846 226 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 P04436 131 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 HIST1H2ABP04908 130 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 F8A1P23610 371 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 SOX3P41225 446 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CYB561P49447 251 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 FOXL2P58012 376 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 GABARAPL2P60520 117 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 RPS18P62269 152 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 IL5RAQ01344 420 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 PLAURQ03405 335 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 RAPSNQ13702 412 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 BLMHQ13867 455 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.76□□□□□ -1.012e-7■□□□□ 10.6
HDLBP-211ENST00000425989 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ZBED5Q49AG3 693 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ABHD17BQ5VST6 288 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 BROXQ5VW32 411 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CBLN3Q6UW01 205 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 IL20RBQ6UXL0 311 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 P3H2Q8IVL5 708 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 FAM26EQ8N5C1 309 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 OR52L1Q8NGH7 329 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 HIST1H2ACQ93077 130 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ZBTB8AQ96BR9 441 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 RNF31Q96EP0 1072 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 SGTBQ96EQ0 304 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM41AQ96HV5 264 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 MRGPRX4Q96LA9 322 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 SLC38A2Q96QD8 506 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 POTEKPQ9BYX7 375 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 DPH1Q9BZG8 443 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 SH2D2AQ9NP31 389 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CTPS2Q9NRF8 586 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF337Q9Y3M9 751 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 WIF1Q9Y5W5 379 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 PIEZO1Q92508 2521 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 IRGMA1A4Y4 181 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 LINC01387J3KSC0 135 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 SCO2O43819 266 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 GNAO1P09471 354 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 FUT1P19526 365 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CNR1P21554 472 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 POU1F1P28069 291 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TACR3P29371 465 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CCR4P51679 360 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 MYBPC1Q00872 1141 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CD47Q08722 323 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TMED1Q13445 227 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 GINS1Q14691 196 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 QPRTQ15274 297 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 OCLNQ16625 522 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TBC1D25Q3MII6 688 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 C12orf73Q69YU5 71 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM154Q6P9G4 183 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 SMARCD3Q6STE5 483 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 OAFQ86UD1 273 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 PLCZ1Q86YW0 608 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF786Q8N393 782 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 FADS6Q8N9I5 356 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 GATSQ8NAP1 163 aa8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms