RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395549.3

ATG13-202, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 5

Gene ATG13, Length 937 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-202ENST00000395549 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG13-202ENST00000395549 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG13-202ENST00000395549 TPT1P8Q9HAU6 139 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG13-202ENST00000395549 CTPS2Q9NRF8 586 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG13-202ENST00000395549 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG13-202ENST00000395549 AP3D1O14617 1153 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 SIAH2O43255 324 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 ADAM11O75078 769 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 RAF1P04049 648 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 BCHEP06276 602 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 DBIP07108 87 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 TFPIP10646 304 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 IL7RP16871 459 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 CRYGSP22914 178 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 MAGEA8P43361 318 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 AQP5P55064 265 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 DSTNP60981 165 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 PPP2R2AP63151 447 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 GNA13Q14344 377 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 MAPK11Q15759 364 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 SLC2A7Q6PXP3 512 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 BEND4Q6ZU67 534 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 GRINAQ7Z429 371 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 CMIPQ8IY22 773 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 SLC43A2Q8N370 569 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 GTF2H4Q92759 462 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 PIK3IP1Q96FE7 263 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 FOXC2Q99958 501 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 CCDC28BQ9BUN5 200 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 CCDC106Q9BWC9 280 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 FANCFQ9NPI8 374 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 PRR14LQ5THK1 2151 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 DEFB108AA8MXU0 73 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 FESP07332 822 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 KLK2P20151 261 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 IDH2P48735 452 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 DIO1P49895 249 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 KEAP1Q14145 624 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 TFAP2EQ6VUC0 442 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 PEX5LQ8IYB4 626 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 PMM1Q92871 262 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 DNAJA3Q96EY1 480 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 PSD2Q9BQI7 771 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 GP6Q9HCN6 339 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 CALML5Q9NZT1 146 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 CHRNA9Q9UGM1 479 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 ITPR3Q14573 2671 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 SULT2B1O00204 365 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 NR5A2O00482 541 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 CYTIPO60759 359 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 ATE1O95260 518 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 YES1P07947 543 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 PPP3CBP16298 524 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 CCNA2P20248 432 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 CRISP3P54108 245 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 LIN52Q52LA3 116 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 VRK2Q86Y07 508 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 OR52P1PQ8NH57 321 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 TMEM19Q96HH6 336 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 ACTR6Q9GZN1 396 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 CCDC167Q9P0B6 97 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 DSPPQ9NZW4 1301 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 DSCAMO60469 2012 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 TMEM247A6NEH6 219 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 CLIC1O00299 241 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 THBDP07204 575 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 TFPTP0C1Z6 253 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 EPS8Q12929 822 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 ZNF836Q6ZNA1 936 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 ADGRG3Q86Y34 549 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 FUNDC1Q8IVP5 155 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 SLC38A5Q8WUX1 472 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 CKAP2Q8WWK9 683 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 MBD6Q96DN6 1003 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 SPDL1Q96EA4 605 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG13-202ENST00000395549 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms