RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 A0A087WUU8 490 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 TMPRSS11DO60235 418 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC43A1O75387 559 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 PKLRP30613 574 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 ETV5P41161 510 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 ETV1P50549 477 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 SFXN4Q6P4A7 337 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 OR4C15Q8NGM1 316 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 ABHD4Q8TB40 342 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC120Q96HB5 630 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 CBLCQ9ULV8 474 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 CSF1P09603 554 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 FOXK2Q01167 660 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 CDC20Q12834 499 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 COL28A1Q2UY09 1125 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC35F3Q8IY50 421 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 INTS14Q96SY0 518 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 NDUFB11Q9NX14 153 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN2-201ENST00000389413 TVP23AA6NH52 213 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 VSTM2BA6NLU5 285 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 UGT2B7P16662 529 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 PBX2P40425 430 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 CEBPGP53567 150 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 ACSM5Q6NUN0 579 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 SEMA4GQ9NTN9 838 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC6A5Q9Y345 797 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 WNK3Q9BYP7 1800 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 OR7A10O76100 309 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 SCGB1D2O95969 90 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 OR2T7P0C7T2 308 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 ARSBP15848 533 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 RBMXP38159 391 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 PRKXP51817 358 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 CRMP1Q14194 572 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC58Q4VC31 144 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 USP53Q70EK8 1073 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEFF1Q8IYR6 380 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 OR9A4Q8NGU2 314 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 OR2T27Q8NH04 317 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 SHDQ96IW2 340 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 OR51B4Q9Y5P0 310 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 ARPC5O15511 151 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 PET100P0DJ07 73 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 SGCBQ16585 318 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM76BQ5HYJ3 339 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 TANGO2Q6ICL3 276 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 BEST4Q8NFU0 473 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 OR56B4Q8NH76 319 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 SPPL3Q8TCT6 385 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 PTTG3PQ9NZH4 202 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF281Q9Y2X9 895 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 TEAD1P28347 426 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.019e-7■■■■□ 24.1
PTPRN2-201ENST00000389413 SIRPAP78324 504 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 22.3
PTPRN2-201ENST00000389413 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 MFSD13AQ14CX5 517 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 WDR45BQ5MNZ6 344 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 WBP2NLQ6ICG8 309 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 MS4A6EQ96DS6 147 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 HHATLQ9HCP6 504 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 POT1Q9NUX5 634 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 TP53I11O14683 189 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC22A5O76082 557 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 ALDOBP05062 364 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 RAB40ALP0C0E4 278 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 CRABP1P29762 137 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 DDOSTP39656 456 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 PLXDC1Q8IUK5 500 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 RAB40AQ8WXH6 277 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 EID2BQ96D98 161 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 CHST8Q9H2A9 424 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 GMEB2Q9UKD1 530 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 RCE1Q9Y256 329 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 SDK1Q7Z5N4 2213 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 GOSR2O14653 212 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 CXCL10P02778 98 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 SGCAQ16586 387 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 PAQR6Q6TCH4 344 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 LYPD4Q6UWN0 246 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 NOX3Q9HBY0 568 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 C2orf42Q9NWW7 574 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRN2-201ENST00000389413 CA5BQ9Y2D0 317 aa15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms