RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384622.1

RNU6-540P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 540, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-540P, Length 101 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-540P-201ENST00000384622 PLXNC1O60486 1568 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 KIF7Q2M1P5 1343 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 ALKQ9UM73 1620 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 NINQ8N4C6 2090 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZNF236Q9UL36 1845 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 A0A1B0GVG6 124 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 C20orf202A1L168 122 aa-1.49□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 C12orf71A8MTZ7 269 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 C2CD4DB7Z1M9 353 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 TCP10L2B9ZVM9 353 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 TMEM250H0YL14 139 aa-1.49□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 APAF1O14727 1248 aa-1.49□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 F10P00742 488 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 PCCBP05166 539 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 URODP06132 367 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 RB1P06400 928 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 LYNP07948 512 aa-1.49□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 UGT1A5P35504 534 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 OPRK1P41145 380 aa-1.49□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 PPP2R2BQ00005 443 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 IFITM3Q01628 133 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 BCL2L1Q07817 233 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 ARHGAP1Q07960 439 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 PHKG1Q16816 387 aa-1.49□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 TYSND1Q2T9J0 566 aa-1.49□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 FAM209BQ5JX69 171 aa-1.49□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 OR4C11Q6IEV9 310 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 RNF165Q6ZSG1 346 aa-1.49□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 GIMAP1Q8WWP7 306 aa-1.49□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 TAF4BQ92750 862 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 HAS2Q92819 552 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 SMIM14Q96QK8 99 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 NUDCD1Q96RS6 583 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 GPA33Q99795 319 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 PRSS27Q9BQR3 290 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 POLR3GLQ9BT43 218 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 DEFB129Q9H1M3 183 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR51V1Q9H2C8 321 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 NIPAL2Q9H841 368 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 UGT1A7Q9HAW7 530 aa-1.49□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 MARCH5Q9NX47 278 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 NDUFA13Q9P0J0 144 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 ONECUT1Q9UBC0 465 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 SEC14L3Q9UDX4 400 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 LCMT1Q9UIC8 334 aa-1.49□□□□□ -2.65
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