RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372906.2

TTPAL-203, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTPAL, Length 1,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-203ENST00000372906 STACQ99469 402 aa11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-203ENST00000372906 CCT7Q99832 543 aa11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-203ENST00000372906 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-203ENST00000372906 DUSP22Q9NRW4 184 aa11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-203ENST00000372906 FIS1Q9Y3D6 152 aa11.78□□□□□ -0.52
TTPAL-203ENST00000372906 CIB4A0PJX0 185 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 CCT8L1PA6NM43 557 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 H7C417 338 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 SLC28A1O00337 649 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 HSPA4LO95757 839 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 DHRS4L1P0CG22 281 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 ATP6V1C1P21283 382 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 THBS2P35442 1172 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 DIO1P49895 249 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 CCR4P51679 360 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 ATP12AP54707 1039 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 RPL38P63173 70 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 DCST2Q5T1A1 773 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 FBXW9Q5XUX1 488 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 WDR31Q8NA23 367 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF527Q8NB42 609 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 OR5W2Q8NH69 310 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 PROX1Q92786 737 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 PRR14Q9BWN1 585 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 HOXD1Q9GZZ0 328 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 GPATCH2Q9NW75 528 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 KCNE5Q9UJ90 142 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 MGAT4BQ9UQ53 548 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 DTNAQ9Y4J8 743 aa11.77□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 H3BNH8 94 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF264O43296 627 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 PROCP04070 461 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 LAMP1P11279 417 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 BCKDHAP12694 445 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 CCT3P49368 545 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 EFNA4P52798 201 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 SESN3P58005 492 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 SLC25A3Q00325 362 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 TP53BP2Q13625 1128 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 GGTLC2Q14390 218 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 GABRA6Q16445 453 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 GALNTL6Q49A17 601 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 CFAP157Q5JU67 520 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 PDZK1Q5T2W1 519 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 C9orf135Q5VTT2 229 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 LIPMQ5VYY2 423 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 TMPPEQ6ZT21 453 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 ACMSDQ8TDX5 336 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 ADAMTS15Q8TE58 950 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 C3orf49Q96BT1 292 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 C1orf159Q96HA4 380 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 INPP5KQ9BT40 448 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 ACTRT3Q9BYD9 372 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 GIMAP2Q9UG22 337 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 DCDC2Q9UHG0 476 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 TRAF6Q9Y4K3 522 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 ATP23Q9Y6H3 246 aa11.76□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF716A6NP11 495 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 VWC2LB2RUY7 222 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 SULT2B1O00204 365 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 LSM1O15116 133 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 CYP7B1O75881 506 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 ITGA5P08648 1049 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 UBL4AP11441 157 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 DNAJB13P59910 316 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 CBX1P83916 185 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 SKP2Q13309 424 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 CBFBQ13951 182 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 MLC1Q15049 377 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 MST1LQ2TV78 715 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 FAM166AQ6J272 317 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF544Q6NX49 715 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 C3orf33Q6P1S2 294 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 KLHL17Q6TDP4 642 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC103Q8IW40 242 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 OR52E4Q8NGH9 312 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 OR5D16Q8NGK9 328 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC126Q96EE4 140 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 ARL5BQ96KC2 179 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 MUS81Q96NY9 551 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 SDF2Q99470 211 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 SOX7Q9BT81 388 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 OXSMQ9NWU1 459 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 ATP6V1HQ9UI12 483 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 KCNS2Q9ULS6 477 aa11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa11.74□□□□□ -0.53
TTPAL-203ENST00000372906 SERINC4A6NH21 518 aa11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms