RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368147.8

SPTA1-201, Transcript of spectrin alpha, erythrocytic 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTA1, Length 7,999 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Dendrite .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1-201ENST00000368147 RAB3DO95716 219 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 CPT2P23786 658 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 NFYBP25208 207 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ETV6P41212 452 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 DCDP81605 110 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 KCNAB2Q13303 367 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 CES4AQ5XG92 561 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 RAB39BQ96DA2 213 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SMIM14Q96QK8 99 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 CENPOQ9BU64 300 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SCN9AQ15858 1988 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 HBE1P02100 147 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 DNASE1P24855 282 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ITGB7P26010 798 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PAX6P26367 422 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 GPR85P60893 370 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SLC18B1Q6NT16 456 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 BANPQ8N9N5 519 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MS4A4AQ96JQ5 239 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 A0A1B0GUL6 1792 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 A0A1W2PQ09 198 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ELK4P28324 431 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SULT1A2P50226 295 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MEP1AQ16819 746 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 UGT3A2Q3SY77 523 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ENPP6Q6UWR7 440 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 DPH1Q9BZG8 443 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 LINC01553A4QN01 128 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 FRS3O43559 492 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SYT7O43581 403 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 DFNA5O60443 496 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 HEXAP06865 529 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 POU4F2Q12837 409 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TMEM64Q6YI46 380 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PQLC3Q8N755 202 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PPT1P50897 306 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SSR4P51571 173 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 RRADP55042 308 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 NDUFA6P56556 154 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 REEP5Q00765 189 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SLC14A2Q15849 920 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PLBD1Q6P4A8 553 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 KLBQ86Z14 1044 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MFSD6LQ8IWD5 586 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 OR2T33Q8NG76 320 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF675Q8TD23 568 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 FAM46BQ96A09 425 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PTERQ96BW5 349 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 APIPQ96GX9 242 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 OR4K3Q96R72 315 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PHOX2BQ99453 314 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SMOXQ9NWM0 555 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TGOLN2O43493 480 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ERVK-25P63136 954 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 HOXC5Q00444 222 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 CTBSQ01459 385 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms