RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 PLBD1Q6P4A8 553 aa16.37■□□□□ 0.21
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ACTB-201ENST00000331789 BMPERQ8N8U9 685 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 APCDD1LQ8NCL9 501 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 PROKR2Q8NFJ6 384 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 SEMA4CQ9C0C4 833 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 LAT2Q9GZY6 243 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 CLPXO76031 633 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 PPP1R3DO95685 299 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
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ACTB-201ENST00000331789 C3orf38Q5JPI3 329 aa16.36■□□□□ 0.21
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ACTB-201ENST00000331789 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa16.36■□□□□ 0.21
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ACTB-201ENST00000331789 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
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ACTB-201ENST00000331789 AGBL5Q8NDL9 886 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 ELOA3Q8NG57 546 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 OR4F15Q8NGB8 312 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 PMEPA1Q969W9 287 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 C8orf44Q96CB5 159 aa16.35■□□□□ 0.21
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ACTB-201ENST00000331789 BDP1A6H8Y1 2624 aa16.35■□□□□ 0.21
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ACTB-201ENST00000331789 FAM86C2PA6NEL3 165 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 ALG1L2C9J202 215 aa16.34■□□□□ 0.21
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ACTB-201ENST00000331789 OR2G6Q5TZ20 316 aa16.34■□□□□ 0.21
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ACTB-201ENST00000331789 CENPOQ9BU64 300 aa16.34■□□□□ 0.21
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ACTB-201ENST00000331789 DCSTAMPQ9H295 470 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 SLC26A1Q9H2B4 701 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 VPS13AQ96RL7 3174 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PQD3 144 aa16.33■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 FADS1O60427 444 aa16.33■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 PPM1BO75688 479 aa16.33■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 OR7A10O76100 309 aa16.33■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 INHBBP09529 407 aa16.33■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 PNMTP11086 282 aa16.33■□□□□ 0.21
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