RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327331.2

CDCA8-201, Transcript of cell division cycle associated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDCA8, Length 2,303 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8-201ENST00000327331 SCN1BQ07699 218 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 SERTAD2Q14140 314 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF79Q15937 498 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 TIGD3Q6B0B8 471 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 PRR22Q8IZ63 422 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 DTX3Q8N9I9 347 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 OR52P1PQ8NH57 321 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 SLC2A12Q8TD20 617 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 TMEM80Q96HE8 168 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 VSTM2LQ96N03 204 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 GAL3ST4Q96RP7 486 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 COQ3Q9NZJ6 369 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 PISDQ9UG56 409 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 KCNE5Q9UJ90 142 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 PADI2Q9Y2J8 665 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 CHST2Q9Y4C5 530 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 MMACHCQ9Y4U1 282 aa10.7□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 A0A0G2JPF8 293 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 BLACEA4D250 179 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 FFAR1O14842 300 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 HEXBP07686 556 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 FGF5P12034 268 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 HLA-DMAP28067 261 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 ASAH1Q13510 395 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF615Q8N8J6 731 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 OR4M2Q8NGB6 313 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 OR6T1Q8NGN1 323 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF354BQ96LW1 612 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 NUDT9Q9BW91 350 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 HDHD5Q9BXW7 423 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 REEP1Q9H902 201 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 RNF121Q9H920 327 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 BCL2L10Q9HD36 194 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 AMBNQ9NP70 447 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 LIPT1Q9Y234 373 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 NINQ8N4C6 2090 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 PRAMEF2O60811 474 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 RFPL3O75679 317 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 DDAH2O95865 285 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 PTHP01270 115 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 HSMCR30P0CW71 290 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 FPR1P21462 350 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 RORAP35398 523 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 FUT7Q11130 342 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 NPRL3Q12980 569 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP10.69□□□□□ -0.71e-6■■□□□ 12.2
CDCA8-201ENST00000327331 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 PAMR1Q6UXH9 720 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 ATG16L2Q8NAA4 619 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 DEFB124Q8NES8 71 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 GGHQ92820 318 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 MR1Q95460 341 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 CMKLR1Q99788 373 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 SRRQ9GZT4 340 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 OR10H1Q9Y4A9 318 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF292O60281 2723 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 DSPPQ9NZW4 1301 aa10.69□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 EFCAB10A6NFE3 127 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 TNFRSF11BO00300 401 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 PCDH17O14917 1159 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 NKX2-2O95096 273 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 CT45A8P0DMV1 189 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 CT45A9P0DMV2 189 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 MAP3K8P41279 467 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 SLC37A1P57057 533 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 MC2RQ01718 297 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 GNA13Q14344 377 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 IL11RAQ14626 422 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 CSRP2Q16527 193 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 CT45A2Q5DJT8 189 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF836Q6ZNA1 936 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF721Q8TF20 911 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF350Q9GZX5 532 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 DUSP22Q9NRW4 184 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 HSPB11Q9Y547 144 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 ENPP4Q9Y6X5 453 aa10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CDCA8-201ENST00000327331 CLCA1A8K7I4 914 aa10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms