RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A20A6NK97 555 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 FRS3O43559 492 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 CXCL13O43927 109 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 AQP8O94778 261 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 CTSSP25774 331 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 PRKAR1BP31321 381 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 CRYBA2P53672 197 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 SELENBP1Q13228 472 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 VMACQ2NL98 169 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 CHMP1BQ7LBR1 199 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 GRINAQ7Z429 371 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ZNF440Q8IYI8 595 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ZNF563Q8TA94 476 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 SH3GL1Q99961 368 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 RNF122Q9H9V4 155 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 CMTM6Q9NX76 183 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ZNF175Q9Y473 711 aa19.99■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 CELSR2Q9HCU4 2923 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 FAM90A27PA6NNH2 459 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 AIM2O14862 343 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ME2P23368 584 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 PCGF2P35227 344 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 SLC1A3P43003 542 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 GUSBP1Q15486 140 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 GCNT2Q8N0V5 402 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ZFP3Q96NJ6 502 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 SRXN1Q9BYN0 137 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 OSGIN1Q9UJX0 560 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ADAM21Q9UKJ8 722 aa19.98■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PNR3 127 aa19.97■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 M0QX08 132 aa19.97■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 TNFSF13O75888 250 aa19.97■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 IL18BPO95998 194 aa19.97■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 HOXC5Q00444 222 aa19.97■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 HBMQ6B0K9 141 aa19.97■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 SLC15A3Q8IY34 581 aa19.97■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ANKS4BQ8N8V4 417 aa19.97■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 SLC35B4Q969S0 331 aa19.97■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 JKAMPQ9P055 326 aa19.97■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 PRDM4Q9UKN5 801 aa19.97■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ANGPT4Q9Y264 503 aa19.97■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 CENPEQ02224 2701 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 CCT8L1PA6NM43 557 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 BMP5P22003 454 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 TACR3P29371 465 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 PRDX6P30041 224 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 CARD18P57730 90 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 SGCBQ16585 318 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 DUSP7Q16829 419 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 C3orf33Q6P1S2 294 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 HACD2Q6Y1H2 254 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 CCDC80Q76M96 950 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ZNF550Q7Z398 422 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 KRT73Q86Y46 540 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 GPR32P1Q8NGA4 272 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ZNF607Q96SK3 696 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ECSITQ9BQ95 431 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 EFCAB1Q9HAE3 211 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 KCNJ16Q9NPI9 418 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 CHRNA9Q9UGM1 479 aa19.96■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 PKDREJQ9NTG1 2253 aa19.95■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PNV4 684 aa19.95■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 GJE1A6NN92 205 aa19.95■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 CYSRT1A8MQ03 144 aa19.95■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 TPST2O60704 377 aa19.95■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 FAM107AO95990 144 aa19.95■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 IGFBP2P18065 325 aa19.95■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 P4HA3Q7Z4N8 544 aa19.95■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 ARMC8Q8IUR7 673 aa19.95■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 TAMM41Q96BW9 452 aa19.95■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 CMTM5Q96DZ9 223 aa19.95■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 ARL5BQ96KC2 179 aa19.95■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 PRR14Q9BWN1 585 aa19.95■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 ARMC7Q9H6L4 198 aa19.95■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 CHST11Q9NPF2 352 aa19.95■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 SERINC1Q9NRX5 453 aa19.95■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 UNC79Q9P2D8 2635 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 TMEM72A0PK05 275 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 TMEM229AB2RXF0 380 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 DVL2O14641 736 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 SERPINB7O75635 380 aa19.94■□□□□ 0.78
SYF2-201ENST00000236273 OPN1SWP03999 348 aa19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms