RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 A0A1W2PS29 197 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 I6L893 689 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 DVL2O14641 736 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 CSO75390 466 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 INHAP05111 366 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 ARAFP10398 606 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 PLCXD2Q0VAA5 305 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 TRAV27A0A087WT01 109 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 TAS2R20P59543 309 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 CD163Q86VB7 1156 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 MED20Q9H944 212 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 CERS4Q9HA82 394 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 C9J4A7 227 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 ZNF84P51523 738 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 SDR9C7Q8NEX9 313 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 HPSE2Q8WWQ2 592 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 DHRS9Q9BPW9 319 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 MROH6A6NGR9 719 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 PTGER1P34995 402 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 CXADRP78310 365 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 PDZD11Q5EBL8 140 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 KDM8Q8N371 416 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 NPLOC4Q8TAT6 608 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 CD99L2Q8TCZ2 262 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 TMEM239Q8WW34 195 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 C20orf85Q9H1P6 137 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 MCCC2Q9HCC0 563 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 TMEM82A0PJX8 343 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 FCRLAQ7L513 359 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 TOMM40LQ969M1 308 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 H7C1Q1 480 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 HOXC5Q00444 222 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 LINC00299Q6ZSB3 139 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 HCAR1Q9BXC0 346 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 CWH43Q9H720 699 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 GJB3O75712 270 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 CPNE6O95741 557 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 HTR4Q13639 388 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 SLC25A46Q96AG3 418 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 NOX1Q9Y5S8 564 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 GPR39O43194 453 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 ADRB1P08588 477 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 SNU13P55769 128 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 ACY1Q03154 408 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 C17orf107Q6ZR85 190 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 ZFAND1Q8TCF1 268 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 BPIFA2Q96DR5 249 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 SLC10A3P09131 477 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 RPS21P63220 83 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 PELI3Q8N2H9 469 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 TMEM156Q8N614 296 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 UBXN10Q96LJ8 280 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 INTS14Q96SY0 518 aa9.56□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 IGLON5A6NGN9 336 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 PNMTP11086 282 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 YIF1BQ5BJH7 314 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 OR10K2Q6IF99 312 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 OR8J2Q8NGG1 315 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 NANPQ8TBE9 248 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 PTCHD1Q96NR3 888 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 ZNF281Q9Y2X9 895 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 MPIG6BO95866 241 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 AKR1C2P52895 323 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 SHC2P98077 582 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 DLK2Q6UY11 383 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 RNF111Q6ZNA4 994 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 SFXN4Q6P4A7 337 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 DUSP19Q8WTR2 217 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 NECTIN4Q96NY8 510 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 SYT3Q9BQG1 590 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 FABP6P51161 128 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 RNF32Q9H0A6 362 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 CLEC2DQ9UHP7 191 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 ZNF175Q9Y473 711 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 SNX11Q9Y5W9 270 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 CDK3Q00526 305 aa9.55□□□□□ -0.88
TTL-201ENST00000233336 OR52I1Q8NGK6 324 aa9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms