RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 POU2F2P09086 479 aa20.45■□□□□ 0.86
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HTATSF1-201ENST00000218364 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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HTATSF1-201ENST00000218364 RABL2BQ9UNT1 228 aa20.44■□□□□ 0.86
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HTATSF1-201ENST00000218364 C14orf105Q9NVL8 296 aa20.44■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 FBXL21Q9UKT6 434 aa20.44■□□□□ 0.86
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HTATSF1-201ENST00000218364 RTL4Q6ZR62 310 aa20.43■□□□□ 0.86
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HTATSF1-201ENST00000218364 FHL1Q13642 323 aa20.42■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 TP53I3Q53FA7 332 aa20.42■□□□□ 0.86
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HTATSF1-201ENST00000218364 ADAP2Q9NPF8 381 aa20.42■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 MOSPD1Q9UJG1 213 aa20.42■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 SERTAD3Q9UJW9 196 aa20.42■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A087WV62 115 aa20.42■□□□□ 0.86
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HTATSF1-201ENST00000218364 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa20.42■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 COX18Q8N8Q8 333 aa20.42■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 BEST4Q8NFU0 473 aa20.42■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 OR4E2Q8NGC2 313 aa20.42■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 ASB16Q96NS5 453 aa20.42■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa20.42■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM27Q9HBJ8 222 aa20.42■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 ICAM5Q9UMF0 924 aa20.42■□□□□ 0.86
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