RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mthfd2lD3YZG8 338 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TmppeD3Z286 447 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp616J3QN14 987 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hnrnpa1P49312 320 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cnrip1Q5M8N0 164 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tex261Q62302 196 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rcbtb1Q6NXM2 531 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr298Q7TS06 332 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mblac2Q8BL86 279 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc22a29Q8BWG6 551 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Irf2bp1Q8R3Y8 584 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem5Q8VDX6 444 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1Q8VGI1 314 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lypd2Q9DD23 127 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dennd4aE9Q8V6 1869 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dcst2A0A140LIJ0 701 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam83cA2ARK0 776 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr723E9PZU2 309 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm5799E9Q2M1 201 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Coq10aE9Q3H6 259 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc149F6V035 524 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr724K7N5X7 309 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Syn1O88935 706 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pou2f1P25425 770 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gstm5P48774 224 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr857Q7TRF7 309 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxo5Q7TSG3 421 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MkxQ8BIA3 353 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc35c1Q8BLX4 363 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Leng9Q8BTN6 485 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mettl6Q8BVH9 282 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lamtor1Q9CQ22 161 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q9D8N1 392 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tas2r103Q9JKA3 312 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 9330182O14RikJ3QNB2 140 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lancl1O89112 399 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Drd2P61168 444 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cmklr1P97468 371 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Thbs2Q03350 1172 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FcrlbQ5DRQ8 427 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MertkQ60805 994 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clcn4Q61418 747 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1284Q8VF29 311 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr658Q8VGV5 323 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 WacQ924H7 646 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ankrd10Q99LW0 415 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pnp2Q9D8C9 305 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mcemp1Q9D8U6 183 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnajb1Q9QYJ3 340 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnd3Q9Z0V1 655 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm15013V9GWY0 266 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CntrlA2AL36 2334 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BC025446A0A087WQT1 134 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mamdc4A2AJA7 1228 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 I0C0044D17RikA6PWL3 169 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r169L7N275 304 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Elavl3Q60900 367 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Foxs1Q61574 329 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prg2Q61878 223 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ParpbpQ6IRT3 573 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxo9Q8BK06 437 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plekhm3Q8BM47 761 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc43a1Q8BSM7 564 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cnppd1Q8K158 407 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 V1ra11Q8R2E6 318 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HpgdQ8VCC1 269 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r45Q8VIC7 318 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Camk2gQ923T9 529 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spef1Q99JL1 234 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tpra1Q99MU1 369 aa14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrps15Q9DC71 258 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HnrnpdlQ9Z130 301 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm42372A0A1B0GT27 204 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd101A8E0Y8 1033 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wscd2D4PHA7 571 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bhlhe40O35185 411 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FhitO89106 150 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tgfb1P04202 390 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd28P31041 218 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NcanP55066 1268 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SnrpnP63163 240 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acp5Q05117 327 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc30a1Q60738 503 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RybpQ8CCI5 228 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mill2Q8HWE5 355 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Epsti1Q8VDI1 314 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr120Q8VFQ2 330 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pkmyt1Q9ESG9 490 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc9a3r2Q9JHL1 337 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aldh3b2E9Q3E1 479 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd14P10810 366 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fabp1P12710 127 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd3eapQ76KJ5 399 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clba1Q8BHN9 321 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mfsd11Q8BJ51 449 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Agpat4Q8K4X7 378 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Or51e2Q8VBV9 320 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hrh4Q91ZY2 391 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bcl7bQ921K9 202 aa14.97□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Syt8Q9R0N6 395 aa14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.8 ms