RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641901.1

SAMMSON-222, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, human

BASIC

Gene SAMMSON, Length 2,727 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAMMSON-222	ENST00000641901	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901		A0A0G2JNG1	304 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	HR	O43593	1189 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	SDC3	O75056	442 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	NKX2-2	O95096	273 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	NGFR	P08138	427 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	CTSE	P14091	401 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	BMP7	P18075	431 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	S1PR1	P21453	382 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	NOS3	P29474	1203 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	SLC16A1	P53985	500 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	RAB38	P57729	211 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	DAB2	P98082	770 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	FOXK2	Q01167	660 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	TCF15	Q12870	199 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM53B	Q14153	422 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	KIR2DS5	Q14953	304 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	KCNJ8	Q15842	424 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	NNAT	Q16517	81 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	AMZ1	Q400G9	498 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	DDI2	Q5TDH0	399 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	OOSP2	Q86WS3	158 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMCO6	Q96DC7	493 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	SPACA7	Q96KW9	195 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	MALT1	Q9UDY8	824 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM186A	A6NE01	2351 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	C10orf142	B7Z368	130 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	GNB5	O14775	395 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	HPGDS	O60760	199 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMCC2	O75069	709 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF217	O75362	1048 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	CSF3	P09919	207 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	SLC35E2	P0CK97	266 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF24	P17028	368 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	DRD5	P21918	477 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	BCKDHB	P21953	392 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	HOXA6	P31267	233 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR2B6	P58173	313 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	MANEA	Q5SRI9	462 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	LNX2	Q8N448	690 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR52N1	Q8NH53	320 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	PEX11G	Q96HA9	241 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	ALG8	Q9BVK2	526 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	MMP28	Q9H239	520 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	MED31	Q9Y3C7	131 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		6.9	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		6.9	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901		A0A0B4J2E0	115 aa		6.9	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901		A0A1B0GWA3	101 aa		6.9	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901		A0A1B0GX12	115 aa		6.9	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901		E9PI62	339 aa		6.9	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	DYRK3	O43781	588 aa		6.9	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	GYPB	P06028	91 aa		6.9	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	NR4A2	P43354	598 aa		6.9	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	BTG2	P78543	158 aa		6.9	□□□□□ -1.3
SAMMSON-222	ENST00000641901	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3

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