RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-223ENST00000592576 NTN1O95631 604 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 NME2P22392 152 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 MSX1P28360 303 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 RFC3P40938 356 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 FOXO1Q12778 655 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 QPRTQ15274 297 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 LRRC36Q1X8D7 754 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 ZNF766Q5HY98 468 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 ALG10BQ5I7T1 473 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 FGD3Q5JSP0 725 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 WBP2NLQ6ICG8 309 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 ZNF613Q6PF04 617 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 HS3ST5Q8IZT8 346 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 PIK3C3Q8NEB9 887 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 OR2M7Q8NG81 312 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 DHRS1Q96LJ7 313 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 OAZ3Q9UMX2 235 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 A0A1W2PRQ8 180 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 ANKUB1A6NFN9 424 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 FAAHO00519 579 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 PEX1O43933 1283 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 ITGB2P05107 769 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 ZNF23P17027 643 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 PTNP21246 168 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 IFNA8P32881 189 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 SLC1A3P43003 542 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 ST3GAL3Q11203 375 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 DGCR6Q14129 220 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 TRIP10Q15642 601 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 IGFL3Q6UXB1 125 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 TM9SF4Q92544 642 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 C3orf49Q96BT1 292 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 ZNF597Q96LX8 424 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 NPAS1Q99742 590 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 CIB1Q99828 191 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 FAM173AQ9BQD7 235 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 TAS2R10Q9NYW0 307 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 RFPL3SP0C7P2 107 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 HMGA2P52926 109 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 ULK3Q6PHR2 472 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 EPHX4Q8IUS5 362 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 NKAIN4Q8IVV8 208 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 ZADH2Q8N4Q0 377 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 SCMH1Q96GD3 660 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 HHATLQ9HCP6 504 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 MED17Q9NVC6 651 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 FREM3P0C091 2139 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 PDLIM1O00151 329 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 LYPD3O95274 346 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 PEX2P28328 305 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 LIMS1P48059 325 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 TRAM2Q15035 370 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 SEC23BQ15437 767 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 LPCAT4Q643R3 524 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 TMEM178AQ8NBL3 297 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 OR4C15Q8NGM1 316 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 NRG4Q8WWG1 115 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 NR4A3Q92570 626 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 EPYCQ99645 322 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 CHP2O43745 196 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 CBR3O75828 277 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 FAM87AP0C7U9 286 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 GP1BBP13224 206 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 PRKCAP17252 672 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 PRKACGP22612 351 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 DPP4P27487 766 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 TACR3P29371 465 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 SMIM11AP58511 58 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 FOXK1P85037 733 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 PLPPR5Q32ZL2 321 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 PODNL1Q6PEZ8 512 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-223ENST00000592576 TBPL2Q6SJ96 375 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms