RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588477.5

IFT20-216, Transcript of intraflagellar transport 20, human

TSL 5 BASIC

Gene IFT20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT20-216	ENST00000588477	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	KIAA0040	Q15053	153 aa		13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	GABRA6	Q16445	453 aa		13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	CARTPT	Q16568	116 aa		13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF614	Q8N883	585 aa		13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	PPCDC	Q96CD2	204 aa		13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	FBXO17	Q96EF6	278 aa		13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	SOX7	Q9BT81	388 aa		13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	TRMO	Q9BU70	441 aa		13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	REEP4	Q9H6H4	257 aa		13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	FKRP	Q9H9S5	495 aa		13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	ASB6	Q9NWX5	421 aa		13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	FKBP7	Q9Y680	259 aa		13.4	□□□□□ -0.26
IFT20-216	ENST00000588477	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		13.4	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	SULT2B1	O00204	365 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	DIO1	P49895	249 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	CCR4	P51679	360 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	PHC1	P78364	1004 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	QPRT	Q15274	297 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	CDC73	Q6P1J9	531 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	RELL1	Q8IUW5	271 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	APH1A	Q96BI3	265 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	MUS81	Q96NY9	551 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	STAC	Q99469	402 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	PIGU	Q9H490	435 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	EMC3	Q9P0I2	261 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF264	O43296	627 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	TBX19	O60806	448 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	CRCP	O75575	148 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF23	P17027	643 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	NTF4	P34130	210 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	ATP12A	P54707	1039 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	CBFB	Q13951	182 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	MST1L	Q2TV78	715 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	WDR31	Q8NA23	367 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	OR5W2	Q8NH69	310 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	ARL8A	Q96BM9	186 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	TSSK3	Q96PN8	268 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	ADAM19	Q9H013	955 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	13.38	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF716	A6NP11	495 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	ESPN	B1AK53	854 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	GSTA1	P08263	222 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	ITGA5	P08648	1049 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	MLC1	Q15049	377 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	PDK3	Q15120	406 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	DCST2	Q5T1A1	773 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	C1orf109	Q9NX04	203 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IFT20-216	ENST00000588477	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		13.37	□□□□□ -0.27

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