RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF683Q8IZ20 524 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PGAM4Q8N0Y7 254 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 NANOGP1Q8N7R0 232 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PXT1Q8NFP0 134 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 OR2M7Q8NG81 312 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 OR1M1Q8NGA1 313 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 OR2I1PQ8NGU4 316 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 OR4K15Q8NH41 348 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 OR56A3Q8NH54 315 aa2.81□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 PIH1D2Q8WWB5 315 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 DDB2Q92466 427 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 GLYATL1Q969I3 302 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 SLC35C1Q96A29 364 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 SLCO4A1Q96BD0 722 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ARSGQ96EG1 525 aa2.81□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa2.81□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 CPNE5Q9HCH3 593 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM36Q9NQ86 728 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 SIRT7Q9NRC8 400 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TMLHEQ9NVH6 421 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf109Q9NX04 203 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 MAT2BQ9NZL9 334 aa2.81□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 PHF11Q9UIL8 331 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PITPNC1Q9UKF7 332 aa2.81□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP2.81□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 OR10H1Q9Y4A9 318 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 OR51B4Q9Y5P0 310 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ARL5AQ9Y689 179 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PP64 1363 aa2.81□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CEP152O94986 1710 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TAF1P21675 1872 aa2.81□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 PCM1Q15154 2024 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 MYH7P12883 1935 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PSME4Q14997 1843 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 HMGXB3Q12766 1538 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 FANCAO15360 1455 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PTPRTO14522 1441 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PIK3C2GO75747 1445 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ZFYVE9O95405 1425 aa2.8□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 EMSYQ7Z589 1322 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0U1RRA0 63 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PRSS38A1L453 326 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 GJE1A6NN92 205 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF785A8K8V0 405 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 LEUTXA8MZ59 168 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 C9J4A7 227 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 H3BNH8 94 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 H7C2Y5 167 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 RAB27BO00194 218 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CXCR6O00574 342 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CYB561D2O14569 222 aa2.8□□□□□ -1.96
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