RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	STPG1	Q5TH74	334 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	IRGC	Q6NXR0	463 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MED27	Q6P2C8	311 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SPESP1	Q6UW49	350 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ADCK2	Q7Z695	626 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PAQR7	Q86WK9	346 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OOSP2	Q86WS3	158 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR2T11	Q8NH01	316 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TGM7	Q96PF1	710 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR2A5	Q96R48	311 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR52B2	Q96RD2	323 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	EDEM2	Q9BV94	578 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RAB33B	Q9H082	229 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR51B5	Q9H339	312 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	EHD1	Q9H4M9	534 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	NT5DC2	Q9H857	520 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PELI2	Q9HAT8	420 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	POMT2	Q9UKY4	750 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RP1	P56715	2156 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0C4DFX4	3053 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0J9YY10	115 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PP11	408 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TRBC2	A0A5B9	178 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	LRIT2	A6NDA9	550 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934		H0YGG7	62 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SLC28A1	O00337	649 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	HAT1	O14929	419 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ADAMDEC1	O15204	470 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FLRT2	O43155	660 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ZW10	O43264	779 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TMCC2	O75069	709 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	LRP3	O75074	770 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	LDB3	O75112	727 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJB6	O75190	326 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PEX11A	O75192	247 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PGM3	O95394	542 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CPNE6	O95741	557 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	C9	P02748	559 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SERPIND1	P05546	499 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CDH3	P22223	829 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ACP1	P24666	158 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CAPZB	P47756	277 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	GABRA4	P48169	554 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FUT6	P51993	359 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	REEP5	Q00765	189 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RELA	Q04206	551 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	KIAA0040	Q15053	153 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MEP1A	Q16819	746 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SYT16	Q17RD7	645 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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