RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLIC3O95833 236 aa15.72■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 NPRL3Q12980 569 aa15.72■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 DEFB109BQ30KR1 87 aa15.72■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 CMPK2Q5EBM0 449 aa15.72■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 TTC23Q5W5X9 447 aa15.72■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 WDR88Q6ZMY6 472 aa15.72■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa15.72■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZER1Q7Z7L7 766 aa15.72■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 NRMQ8IXM6 262 aa15.72■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 UCK2Q9BZX2 261 aa15.72■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.72■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 MED13Q9UHV7 2174 aa15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIP5K1CO60331 668 aa15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 LYPD3O95274 346 aa15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC22A10Q63ZE4 541 aa15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 C1orf94Q6P1W5 598 aa15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLHL17Q6TDP4 642 aa15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 BEST3Q8N1M1 668 aa15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 MPP4Q96JB8 637 aa15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 HS6ST2Q96MM7 605 aa15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLHDC3Q9BQ90 382 aa15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 DGCR6LQ9BY27 220 aa15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 MED11Q9P086 117 aa15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 WIF1Q9Y5W5 379 aa15.71■□□□□ 0.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 A6NL46 340 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 GNAO1P09471 354 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTGDSP41222 190 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 GAS1P54826 345 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 ELOA3BQ3SY89 546 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRT80Q6KB66 452 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDK20Q8IZL9 346 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 ELOA3Q8NG57 546 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 PFN4Q8NHR9 129 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF138Q8WVD3 245 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 C3orf49Q96BT1 292 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 AGAP4Q96P64 663 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANKRD60Q9BZ19 345 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPR83Q9NYM4 423 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 CNIH4Q9P003 139 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 ENOPH1Q9UHY7 261 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 MED31Q9Y3C7 131 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 FREM2Q5SZK8 3169 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 URB1O60287 2271 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADAM10O14672 748 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCL3P10147 92 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 GP1BBP13224 206 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 POU1F1P28069 291 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 CASRP41180 1078 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC1A3P43003 542 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCL11P51671 97 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAPSNQ13702 412 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDK3Q15120 406 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC30A6Q6NXT4 461 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 RTL4Q6ZR62 310 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPR119Q8TDV5 335 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 SGCZQ96LD1 299 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAS2R10Q9NYW0 307 aa15.7■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 H3BN98 237 aa15.69■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 BCKDKO14874 412 aa15.69■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 F10P00742 488 aa15.69■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 IFI30P13284 250 aa15.69■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 TACR3P29371 465 aa15.69■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPR4P46093 362 aa15.69■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 OMPP47874 163 aa15.69■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYB561P49447 251 aa15.69■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 HLCSP50747 726 aa15.69■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 COX10Q12887 443 aa15.69■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 SNTA1Q13424 505 aa15.69■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 QPRTQ15274 297 aa15.69■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 POMZP3Q6PJE2 187 aa15.69■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 P3H2Q8IVL5 708 aa15.69■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 MARVELD2Q8N4S9 558 aa15.69■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 PAQR8Q8TEZ7 354 aa15.69■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 MUS81Q96NY9 551 aa15.69■□□□□ 0.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 GRIP2Q9C0E4 1043 aa15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.1 ms