RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 NDUFS7O75251 213 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 AP2A1O95782 977 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 ASS1P00966 412 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 IFNW1P05000 195 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 IL6P05231 212 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 GPIP06744 558 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 GOLGA8HP0CJ92 632 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 SLC35E2BP0CK96 405 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 SLC35E2P0CK97 266 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 PET100P0DJ07 73 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 ADORA3P0DMS8 318 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 GP1BBP13224 206 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 CHRNB2P17787 502 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 TEAD1P28347 426 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 GCAP28676 217 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 EPHA2P29317 976 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 KDELR2P33947 212 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 ACVR1BP36896 505 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 RPL3P39023 403 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 CSKP41240 450 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 GRIA3P42263 894 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 SLC1A1P43005 524 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 SERPINB9P50453 376 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 PSMD7P51665 324 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 CCR8P51685 355 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 HSPA2P54652 639 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 RAG2P55895 527 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 TMEM50BP56557 158 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 MLF1P58340 268 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 AP3S2P59780 193 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 RBBP4Q09028 425 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 CNTN1Q12860 1018 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 SELENBP1Q13228 472 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 MED21Q13503 144 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 SLC17A1Q14916 467 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 TRAM2Q15035 370 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP3.13□□□□□ -1.915e-6■■■■□ 26.7
CS-232ENST00000552331 ZNF77Q15935 545 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 PPP1R3AQ16821 1122 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 HLA-BQ31612 363 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 FAM153CQ494X1 144 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 ACCSLQ4AC99 568 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 TP53I3Q53FA7 332 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 TMEM35AQ53FP2 167 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 KIAA0895LQ68EN5 471 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 STEAP1BQ6NZ63 245 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 PAQR6Q6TCH4 344 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 ZNF621Q6ZSS3 439 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 Q71RC1 249 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 NIPA1Q7RTP0 329 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 HPS6Q86YV9 775 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 FUNDC1Q8IVP5 155 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 ZNF100Q8IYN0 542 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 ZBED8Q8IZ13 594 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 METTL4Q8N3J2 472 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 LIX1Q8N485 282 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 OR52E5Q8NH55 327 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 MRAPQ8TCY5 172 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 GPR148Q8TDV2 347 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 ASB10Q8WXI3 467 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 HSD17B8Q92506 261 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 PIK3R3Q92569 461 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 BADQ92934 168 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 STMN2Q93045 179 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 UBE2E3Q969T4 207 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 ISOC2Q96AB3 205 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 CXorf40BQ96DE9 158 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 SDSLQ96GA7 329 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 SNF8Q96H20 258 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 ZFP3Q96NJ6 502 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 CLCC1Q96S66 551 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 TIMP4Q99727 224 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 SYT4Q9H2B2 425 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 PPA2Q9H2U2 334 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 C1orf198Q9H425 327 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 PIGUQ9H490 435 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 ALG9Q9H6U8 611 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 WDR54Q9H977 334 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 POPDC2Q9HBU9 364 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 C8orf4Q9NR00 106 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 OLFML3Q9NRN5 406 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 NECAP2Q9NVZ3 263 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 ZNF221Q9UK13 617 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 FBXL4Q9UKA2 621 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 LRRC42Q9Y546 428 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 USP16Q9Y5T5 823 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-232ENST00000552331 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms