RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531967.5

ECHDC1-222, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-222	ENST00000531967	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ACTL9	Q8TC94	416 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	MBOAT7	Q96N66	472 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	OLFM3	Q96PB7	478 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	NICN1	Q9BSH3	213 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	PPL	O60437	1756 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	CPD	O75976	1380 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	JCAD	Q9P266	1359 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	MROH2A	A6NES4	1674 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	CCL24	O00175	119 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	SPINT2	O43291	252 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	NDUFA2	O43678	99 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	B3GAT3	O94766	335 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	COX5B	P10606	129 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	HTR2C	P28335	458 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	P2RY1	P47900	373 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ALDH3B2	P48448	385 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	RGS6	P49758	472 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	CXADR	P78310	365 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	GRB7	Q14451	532 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	PIGG	Q5H8A4	983 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967		Q7L0L9	218 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	PSMG2	Q969U7	264 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TIMD4	Q96H15	378 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TRIM15	Q9C019	465 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	POLD4	Q9HCU8	107 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	NANS	Q9NR45	359 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR1A2	Q9Y585	309 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	SSH2	Q76I76	1423 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967		A0A0J9YVX5	310 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967		E5RJQ4	531 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967		H3BMH7	237 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZMPSTE24	O75844	475 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	NEURL1	O76050	574 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	OAZ2	O95190	189 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967		P04436	131 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	IFNW1	P05000	195 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	IGF1	P05019	195 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	CYP2D6	P10635	497 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	EPHA2	P29317	976 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC1A1	P43005	524 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR3A3	P47888	321 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	CTSC	P53634	463 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	RAB4B	P61018	213 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	OSTN	P61366	133 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	BNIP2	Q12982	314 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	TFDP1	Q14186	410 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZBTB6	Q15916	424 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-222	ENST00000531967	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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