RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 RLIMQ9NVW2 624 aa16.78■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 AKAP6Q13023 2319 aa16.78■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 FREM1Q5H8C1 2179 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 TUBAL3A6NHL2 446 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 MERTKQ12866 999 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 AP1ARQ63HQ0 302 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 CGB2Q6NT52 195 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF836Q6ZNA1 936 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF610Q8N9Z0 462 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 SLC38A5Q8WUX1 472 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 WDR60Q8WVS4 1066 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM19Q96HH6 336 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 LIME1Q9H400 295 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 CTPS2Q9NRF8 586 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 LIPT1Q9Y234 373 aa16.77■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 DSPPQ9NZW4 1301 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 A0A096LPI6 279 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 CTAG2O75638 210 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 SYNGR4O95473 234 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 CRHP06850 196 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 TFPTP0C1Z6 253 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 CCNA2P20248 432 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 ENPP1P22413 925 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 ADH6P28332 368 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 CARD18P57730 90 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 SELENBP1Q13228 472 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 SQLEQ14534 574 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 POU4F3Q15319 338 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 RGNQ15493 299 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 C12orf49Q9H741 205 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 ACER3Q9NUN7 267 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 VAPAQ9P0L0 249 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 P2RX2Q9UBL9 471 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 CHST2Q9Y4C5 530 aa16.76■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 MYO9AB2RTY4 2548 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 A0A0G2JND7 137 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 A6NNC1 897 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 CLIC1O00299 241 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 MSTNO14793 375 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 GKN3PP0CG01 181 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 FCGR2AP12318 317 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 PGCP20142 388 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 LRIF1Q5T3J3 769 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 C22orf34Q6ZV56 151 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 FAM214BQ7L5A3 538 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF550Q7Z398 422 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 OR52P1PQ8NH57 321 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF563Q8TA94 476 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 RNF128Q8TEB7 428 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 ST8SIA1Q92185 356 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 LRRC46Q96FV0 321 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 OR5B2Q96R09 309 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 CCDC106Q9BWC9 280 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 OR11A1Q9GZK7 315 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 PROCRQ9UNN8 238 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 PRR14LQ5THK1 2151 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 OTOGQ6ZRI0 2925 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 SPG11Q96JI7 2443 aa16.75■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 PLGP00747 810 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 PRG2P13727 222 aa16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 EDNRAP25101 427 aa16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 AGTR1P30556 359 aa16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 IDH2P48735 452 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 ATP4BP51164 291 aa16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 SORDQ00796 357 aa16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 CDH24Q86UP0 819 aa16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 RETREG3Q86VR2 466 aa16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 COMTD1Q86VU5 262 aa16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 KIF18BQ86Y91 864 aa16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 CLIP4Q8N3C7 705 aa16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 FAM222BQ8WU58 562 aa16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 ARL5BQ96KC2 179 aa16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 STOML1Q9UBI4 398 aa16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
TSTA3-211ENST00000529899 UQCRHLA0A096LP55 91 aa16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms