RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 CUL1Q13616 776 aa3.83□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 RAPSNQ13702 412 aa3.83□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 GGTA1PQ4G0N0 100 aa3.83□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 ALG10BQ5I7T1 473 aa3.83□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 GRPEL1Q9HAV7 217 aa3.83□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 SLC22A14Q9Y267 594 aa3.83□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 FAM159BA6NKW6 160 aa3.82□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 GOLGA8KD6RF30 607 aa3.82□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 GOLGA8MH3BSY2 632 aa3.82□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 P2RX6O15547 441 aa3.82□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 OR10H2O60403 315 aa3.82□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 ZG16O60844 167 aa3.82□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 MYO1DO94832 1006 aa3.82□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 CLDN9O95484 217 aa3.82□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 CLDN1O95832 211 aa3.82□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 GUCA1CO95843 209 aa3.82□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 KRT6BP04259 564 aa3.82□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 LIM2P55344 173 aa3.82□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 TNFRSF17Q02223 184 aa3.82□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 SLC10A1Q14973 349 aa3.82□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 HEPACAMQ14CZ8 416 aa3.82□□□□□ -1.8
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