RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	SP9	P0CG40	484 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	POU2F1	P14859	743 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	LBP	P18428	481 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	F8A1	P23610	371 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	CXCR2	P25025	360 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	DNAJB1	P25685	340 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	PSMA2	P25787	234 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	SRD5A2	P31213	254 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	GP5	P40197	560 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	NAMPT	P43490	491 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	HAND2	P61296	217 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	FOLH1	Q04609	750 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	BFSP1	Q12934	665 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	PDK3	Q15120	406 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ALX1	Q15699	326 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	SMIM5	Q71RC9	77 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	HORMAD1	Q86X24	394 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	TDH	Q8IZJ6	230 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	KRT35	Q92764	455 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	SLC35C1	Q96A29	364 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	NTNG2	Q96CW9	530 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	CNDP1	Q96KN2	507 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	OPALIN	Q96PE5	141 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	GON7	Q9BXV9	100 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ZBP1	Q9H171	429 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	LY9	Q9HBG7	655 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	GDF3	Q9NR23	364 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	COL4A1	P02462	1669 aa		2.98	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	MYH1	P12882	1939 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1W2PRG6	482 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	RAB19	A4D1S5	217 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	C2orf74	A8MZ97	194 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057		E7EWF7	191 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ACOX3	O15254	700 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	GPAA1	O43292	621 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	FKBP6	O75344	327 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	MYO1D	O94832	1006 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	TGDS	O95455	350 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	APBB3	O95704	486 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF18	P17022	549 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	CYP3A5	P20815	502 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	SOX6	P35712	828 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	TALDO1	P37837	337 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	SLC1A3	P43003	542 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	GYG1	P46976	350 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	MEOX2	P50222	304 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	SLC26A2	P50443	739 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	ARHGDIA	P52565	204 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	PTEN	P60484	403 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	COPZ1	P61923	177 aa		2.97	□□□□□ -1.93
COPS5-208	ENST00000519057	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	2.97	□□□□□ -1.93

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